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Enregistrement W2950923341 · doi:10.82308/32002

Gβγ dimers: understanding their evolutionary divergence, specificity in signalling and non-canonical nuclear functions

2016· article· en· W2950923341 sur OpenAlexfundno aff
Shahriar M. Khan

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University
Mots-clésHeterotrimeric G proteinG protein-coupled receptorBiologyG proteinSignal transductionCell biologyEffectorProtein subunitComputational biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Les protéines G hétérotrimériques interagissent avec les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) et transduisent leurs signaux à l'intérieur des cellules. Ces protéines G sont composées de différentes combinaisons des sous-unités Gα, Gβ et Gγ. La présence de compositions déterminées de sous-unités aussi bien que d'effecteurs distincts à l'intérieur de complexes de signalisation de RCPG suggère qu'il pourrait exister des déterminants structurels uniques menant à l'activation d'évènements de transduction spécifiques. Étant donnée la grande diversité des sous-unités Gβ et Gγ, il devient important de mieux comprendre les différents rôles de ces sous-unités distinctes dans la transduction des signaux. Précédemment, une grande variété de techniques biochimiques et de silençages génétiques ont été utilisés dans le but d'élucider les fonctions du dimère Gβγ et de démontrer la spécificité conférée par différentes combinaisons de Gβγ dans la signalisation des RCPG. Toutefois, aucune de ces études n'a utilisé une approche systématique dans le but de comprendre l'impact de la diversité des sous-unités Gβγ au niveau de la signalisation canonique et non canonique des RCPG. Les objectifs de cette thèse sont, premièrement, d'effectuer une analyse phylogénique des sous-unités Gβ et Gγ. Deuxièmement, dépister à l'aide d'ARN interférant (ARNi) les différents rôles des sous-unités Gβ et Gγ dans les systèmes d'activation de second messager par les RCPG. Finalement, caractériser des fonctions nucléaires des Gβγ dans le contexte d'une nouvelle interaction entre ces dimères et l'ARN polymérase II. En utilisant un système cellulaire hétérologue (cellules HEK 293) et des cultures primaires de rat (fibroblastes cardiaques néonataux de rat) ainsi que les leçons retenues de l'analyse des divergences évolutionnaires des sous-unités Gβ et Gγ, cette thèse démontre que des combinaisons déterminées du dimère Gβγ régulent l'activité de signalisation en aval du récepteur muscarinique M3 et du récepteur de l'angiotensine II de type I. Cette thèse démontre également que ces combinaisons peuvent interagir avec différentes sous-unités de l'ARN polymérase II en réponse à l'activation de RCPG. Pris dans son ensemble, ce travail élargit notre compréhension des différentes combinaisons de dimères de Gβγ dans le contexte de signalisation cellulaire et décrit pour la première fois l'interaction entre l'ARN polymérase II et des dimères précis de Gβγ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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