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Record W2950923341 · doi:10.82308/32002

Gβγ dimers: understanding their evolutionary divergence, specificity in signalling and non-canonical nuclear functions

2016· article· en· W2950923341 on OpenAlexfundno aff
Shahriar M. Khan

Bibliographic record

VenueeScholarship@McGill (McGill) · 2016
Typearticle
Languageen
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Canadian institutionsnot available
FundersCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University
KeywordsHeterotrimeric G proteinG protein-coupled receptorBiologyG proteinSignal transductionCell biologyEffectorProtein subunitComputational biologyGeneticsGene

Abstract

fetched live from OpenAlex

Les protéines G hétérotrimériques interagissent avec les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) et transduisent leurs signaux à l'intérieur des cellules. Ces protéines G sont composées de différentes combinaisons des sous-unités Gα, Gβ et Gγ. La présence de compositions déterminées de sous-unités aussi bien que d'effecteurs distincts à l'intérieur de complexes de signalisation de RCPG suggère qu'il pourrait exister des déterminants structurels uniques menant à l'activation d'évènements de transduction spécifiques. Étant donnée la grande diversité des sous-unités Gβ et Gγ, il devient important de mieux comprendre les différents rôles de ces sous-unités distinctes dans la transduction des signaux. Précédemment, une grande variété de techniques biochimiques et de silençages génétiques ont été utilisés dans le but d'élucider les fonctions du dimère Gβγ et de démontrer la spécificité conférée par différentes combinaisons de Gβγ dans la signalisation des RCPG. Toutefois, aucune de ces études n'a utilisé une approche systématique dans le but de comprendre l'impact de la diversité des sous-unités Gβγ au niveau de la signalisation canonique et non canonique des RCPG. Les objectifs de cette thèse sont, premièrement, d'effectuer une analyse phylogénique des sous-unités Gβ et Gγ. Deuxièmement, dépister à l'aide d'ARN interférant (ARNi) les différents rôles des sous-unités Gβ et Gγ dans les systèmes d'activation de second messager par les RCPG. Finalement, caractériser des fonctions nucléaires des Gβγ dans le contexte d'une nouvelle interaction entre ces dimères et l'ARN polymérase II. En utilisant un système cellulaire hétérologue (cellules HEK 293) et des cultures primaires de rat (fibroblastes cardiaques néonataux de rat) ainsi que les leçons retenues de l'analyse des divergences évolutionnaires des sous-unités Gβ et Gγ, cette thèse démontre que des combinaisons déterminées du dimère Gβγ régulent l'activité de signalisation en aval du récepteur muscarinique M3 et du récepteur de l'angiotensine II de type I. Cette thèse démontre également que ces combinaisons peuvent interagir avec différentes sous-unités de l'ARN polymérase II en réponse à l'activation de RCPG. Pris dans son ensemble, ce travail élargit notre compréhension des différentes combinaisons de dimères de Gβγ dans le contexte de signalisation cellulaire et décrit pour la première fois l'interaction entre l'ARN polymérase II et des dimères précis de Gβγ.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Theoretical or conceptual · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Review · Consensus signal: none
Teacher disagreement score0.003
Threshold uncertainty score0.008

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0010.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0000.001
Scholarly communication0.0010.002
Open science0.0010.001
Research integrity0.0010.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.025
GPT teacher head0.220
Teacher spread0.194 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designTheoretical or conceptual
Domainnot available
GenreReview

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2016
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