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Enregistrement W2951329724 · doi:10.1113/jp278024

Endocytic recycling of Na<sup>+</sup>–K<sup>+</sup>–Cl<sup>−</sup> cotransporter type 2: importance of exon 4

2019· article· en· W2951329724 sur OpenAlexafffund
Andrée‐Anne Marcoux, Samira Slimani, Laurence Tremblay, Rachelle Frenette‐Cotton, Alexandre P. Garneau, Paul Isenring

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité LavalHôtel-Dieu de Québec
Organismes subventionnairesKidney Foundation of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésCotransporterEndocytic cycleExonChemistryInternalizationSymporterTransmembrane domainReabsorptionCell biologyBiophysicsBiochemistryBiologyCellTransporterGeneEndocytosisSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Key points Na + –K + –Cl − cotransporter type 2 (NKCC2) is a 27‐exon membrane protein that is expressed in the thick ascending limb (TAL) of Henle where it is involved in reabsorption of the ultrafiltered NaCl load. It comes as three splice variants that are identical to each other except for the residue composition of exon 4 and that differ in their transport characteristics, functional roles and distributions along the TAL. In this report, it is shown that the variants also differ in their trafficking properties and that two residues in exon 4 play a key role in this regard. One of these residues was also shown to sustain carrier internalization. Through these results, a novel function for the alternatively spliced exon of NKCC2 has been identified and a domain that is involved in carrier trafficking has been uncovered for the first time in a cation–Cl − cotransporter family member. Abstract Na + –K + –Cl − cotransporter type 2 (NKCC2) is a 12‐transmembrane (TM) domain cell surface glycoprotein that is expressed in the thick ascending limb (TAL) of Henle and stimulated during cell shrinkage. It comes as three splice variants (A, B and F) that are identical to each other except for TM2 and the following connecting segment (CS2). Yet, these variants do not share the same localization, transport characteristics and physiological roles along the TAL. We have recently found that while cell shrinkage could exert its activating effect by increasing NKCC2 expression at the cell surface, the variants also responded differentially to this stimulus. In the current work, a mutagenic approach was exploited to determine whether CS2 could play a role in carrier trafficking and identify the residues potentially involved. We found that when the residue of position 238 in NKCC2A (F) and NKCC2B (Y) was replaced by the corresponding residue in NKCC2F (V), carrier activity increased by over 3‐fold and endocytosis decreased concomitantly. We also found that when the residue of position 230 in NKCC2F (M) was replaced by the one in NKCC2B (T), carrier activity and affinity for ions both increased substantially whereas expression at the membrane decreased. Taken together, these results suggest that CS2 is involved in carrier trafficking and that two of its residues, those of positions 238 and 230, are part of an internalization motif. They also indicate that the divergent residue of position 230 plays the dual role of specifying ion affinity and sustaining carrier internalization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,966

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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