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Enregistrement W2952200551 · doi:10.1016/j.stem.2019.05.013

Engineering Genetic Predisposition in Human Neuroepithelial Stem Cells Recapitulates Medulloblastoma Tumorigenesis

2019· article· en· W2952200551 sur OpenAlexaff
Miller Huang, Jignesh Tailor, Qiqi Zhen, Aaron H. Gillmor, Matthew L. Miller, Holger Weishaupt, Justin Chen, Tina Zheng, Emily K. Nash, Lauren McHenry, Zhenyi An, Fubaiyang Ye, Yasuhiro Takashima, James Clarke, Harold Ayetey, Florence M.G. Cavalli, Betty Luu, Branden S. Moriarity, Shirin Ilkhanizadeh, Lukas Chávez, Chunying Yu, Kathreena M. Kurian, Thierry Magnaldo, Nicolas Sévenet, Philipp Koch, Steven M. Pollard, Peter B. Dirks, M Snyder, David A. Largaespada, Yoon Jae Cho, Joanna J. Phillips, Fredrik J. Swartling, A. Sorana Morrissy, Marcel Kool, Stefan M. Pfister, Michael D. Taylor, Austin Smith, William A. Weiss

Notice bibliographique

RevueCell stem cell · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationAlberta Children's HospitalUniversity of CalgaryHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteMedical Research CouncilFondation de l'Avenir pour la Recherche Médicale AppliquéeCancer Research UKWellcome TrustCollege of Natural Resources and Sciences, Humboldt State UniversityHector Stiftung IICentre National de la Recherche ScientifiqueSamuel Waxman Cancer Research FoundationSociété Française de Dermatologie et de Pathologie Sexuellement TransmissibleInstitut National Du CancerBrain Tumour CharityHector StiftungInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleFondation ARC pour la Recherche sur le CancerAgence Nationale de la RechercheScience Foundation IrelandUniversity of California, San FranciscoPediatric Brain Tumor FoundationAmerican Cancer SocietyNational Institutes of HealthUniversité Nice Sophia AntipolisNational Institute for Health and Care ResearchAlex's Lemonade Stand Foundation for Childhood CancerV Foundation for Cancer Research
Mots-clésMedulloblastomaBiologyStem cellCancer researchCarcinogenesisGermlineProgenitor cellTranscriptomePTCH1Neuroepithelial cellNeural stem cellGeneticsCancerSonic hedgehogGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human neural stem cell cultures provide progenitor cells that are potential cells of origin for brain cancers. However, the extent to which genetic predisposition to tumor formation can be faithfully captured in stem cell lines is uncertain. Here, we evaluated neuroepithelial stem (NES) cells, representative of cerebellar progenitors. We transduced NES cells with MYCN, observing medulloblastoma upon orthotopic implantation in mice. Significantly, transcriptomes and patterns of DNA methylation from xenograft tumors were globally more representative of human medulloblastoma compared to a MYCN-driven genetically engineered mouse model. Orthotopic transplantation of NES cells generated from Gorlin syndrome patients, who are predisposed to medulloblastoma due to germline-mutated PTCH1, also generated medulloblastoma. We engineered candidate cooperating mutations in Gorlin NES cells, with mutation of DDX3X or loss of GSE1 both accelerating tumorigenesis. These findings demonstrate that human NES cells provide a potent experimental resource for dissecting genetic causation in medulloblastoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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