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Enregistrement W2952376212 · doi:10.1371/journal.pbio.3000309

AMPK regulates germline stem cell quiescence and integrity through an endogenous small RNA pathway

2019· article· en· W2952376212 sur OpenAlexafffund
Pratik Kadekar, Richard Roy

Notice bibliographique

RevuePLoS Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyGermlineCell biologyAMPKRNA interferenceCaenorhabditis elegansPiwi-interacting RNAChromatinProtein kinase ASomatic cellStem cellRNAGeneticsKinaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During suboptimal growth conditions, Caenorhabditis elegans larvae undergo a global developmental arrest called "dauer." During this stage, the germline stem cells (GSCs) become quiescent in an AMP-activated Protein Kinase (AMPK)-dependent manner, and in the absence of AMPK, the GSCs overproliferate and lose their reproductive capacity, leading to sterility when mutant animals resume normal growth. These defects correlate with the altered abundance and distribution of a number of chromatin modifications, all of which can be corrected by disabling components of the endogenous small RNA pathway, suggesting that AMPK regulates germ cell integrity by targeting an RNA interference (RNAi)-like pathway during dauer. The expression of AMPK in somatic cells restores all the germline defects, potentially through the transmission of small RNAs. Our findings place AMPK at a pivotal position linking energy stress detected in the soma to a consequent endogenous small RNA-mediated adaptation in germline gene expression, thereby challenging the "permeability" of the Weismann barrier.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,965

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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