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Enregistrement W2952632749 · doi:10.1158/2159-8290.cd-19-0061

Glioma Stem Cell–Specific Superenhancer Promotes Polyunsaturated Fatty-Acid Synthesis to Support EGFR Signaling

2019· article· en· W2952632749 sur OpenAlexaff
Ryan C. Gimple, Reilly L. Kidwell, Leo J.Y. Kim, Tengqian Sun, Anthony D. Gromovsky, Qiulian Wu, Megan E Wolf, Deguan Lv, Shruti Bhargava, Li Jiang, Briana C. Prager, Qingsong Ye, Zhe Zhu, Guoxin Zhang, Zhen Dong, Linjie Zhao, Derrick Lee, Junfeng Bi, Andrew E. Sloan, Paul S. Mischel, J. Mark Brown, Hu Cang, Tao Huan, Stephen C. Mack, Qi Xie, Jeremy N. Rich

Notice bibliographique

RevueCancer Discovery · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesChildren's Cancer Research FundNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthBear Necessities Pediatric Cancer FoundationCancer Prevention and Research Institute of TexasAlex's Lemonade Stand Foundation for Childhood Cancer
Mots-clésBiologyPolyunsaturated fatty acidStem cellCancer researchGliomaCell biologyDownregulation and upregulationFatty acidBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma ranks among the most aggressive and lethal of all human cancers. Functionally defined glioma stem cells (GSC) contribute to this poor prognosis by driving therapeutic resistance and maintaining cellular heterogeneity. To understand the molecular processes essential for GSC maintenance and tumorigenicity, we interrogated the superenhancer landscapes of primary glioblastoma specimens and in vitro GSCs. GSCs epigenetically upregulated ELOVL2, a key polyunsaturated fatty-acid synthesis enzyme. Targeting ELOVL2 inhibited glioblastoma cell growth and tumor initiation. ELOVL2 depletion altered cellular membrane phospholipid composition, disrupted membrane structural properties, and diminished EGFR signaling through control of fatty-acid elongation. In support of the translational potential of these findings, dual targeting of polyunsaturated fatty-acid synthesis and EGFR signaling had a combinatorial cytotoxic effect on GSCs. Significance: Glioblastoma remains a devastating disease despite extensive characterization. We profiled epigenomic landscapes of glioblastoma to pinpoint cell state–specific dependencies and therapeutic vulnerabilities. GSCs utilize polyunsaturated fatty-acid synthesis to support membrane architecture, inhibition of which impairs EGFR signaling and GSC proliferation. Combinatorial targeting of these networks represents a promising therapeutic strategy. See related commentary by Affronti and Wellen, p. 1161. This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 1143

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations182
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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