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Enregistrement W2952994334 · doi:10.2196/11553

Diet-Induced Alteration of Microbiota and Development of Obesity, Nonalcoholic Fatty Liver Disease, and Diabetes: Study Protocol of a Prospective Study

2019· article· en· W2952994334 sur OpenAlexvenueno aff
Martine Uittenbogaart, Wouter K. G. Leclercq, Daniëlle S. Bonouvrie, Marleen M. Romeijn, Arijan A. P. M. Luijten, Steven W.M. Olde Damink, François M. H. van Dielen, Sander S. Rensen

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGut floraInternal medicineMedicineGastroenterologyNonalcoholic fatty liver diseaseType 2 diabetesObesityFatty liverProspective cohort studyDiabetes mellitusWeight lossPhysiologyDiseaseEndocrinologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Development of obesity and obesity-related diseases, such as type 2 diabetes mellitus and nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD), is associated with altered gut microbiota composition. The aim of this study is to investigate associations among dietary compounds, intestinal cell function, and gut microbiota composition. We hypothesize that dietary lipid intake is associated with Paneth cell and goblet cell properties that affect gut microbiota composition. OBJECTIVE: The primary objective of this study is to determine whether a difference in dietary intake is associated with a difference in intestinal mucin-2 expression and gut microbiota composition. METHODS: This is a single-center prospective study, including 1 obese group undergoing laparoscopic Roux-en-y gastric bypass and 2 lean control groups undergoing either laparoscopic cholecystectomy or upper gastrointestinal endoscopy (n=228). During laparoscopy, biopsies will be taken of visceral fat (omentum majus), liver, muscle tissue of the abdominal wall, and subcutaneous fat. In the obese group, a small segment of the jejunum will be collected for analysis, which will be compared with an endoscopically derived jejunal biopsy from the upper gastrointestinal endoscopy control group. Stool samples for microbiota profiling will be collected at baseline and 1 year after surgery. Primary outcomes are fecal microbiota composition and mucus characteristics. Secondary outcomes include Paneth cell phenotype, body weight, diet composition, glucose tolerance, resolution of comorbidities, and weight loss 1 year after surgery. RESULTS: This trial is currently open for recruitment. The anticipated completion date is December 2019. CONCLUSIONS: The Diet-Induced Alteration of Microbiota and Development of Obesity, NAFLD, and Diabetes study will improve insight into the pathophysiology of obesity and its associated metabolic disorders. Better understanding of weight loss failure and weight regain following bariatric surgery might also behold new therapeutic opportunities for obesity and obesity-related comorbidities. TRIAL REGISTRATION: Netherlands Trial Register NTR5660; https://www.trialregister.nl/trial/5540 (Archived by WebCite at http://www.webcitation.org/78l7jOZre). INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/11553.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,113

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,003
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0050,003
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,474
Écart entre enseignants0,363 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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