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Enregistrement W2953385041 · doi:10.1038/s41467-019-10422-7

Structural and functional consequences of the STAT5BN642H driver mutation

2019· article· en· W2953385041 sur OpenAlexafffund
Elvin D. de Araujo, Fettah Erdogan, Heidi A. Neubauer, Deniz Meneksedag‐Erol, Pimyupa Manaswiyoungkul, Mohammad S. Eram, Hyuk‐Soo Seo, Abdul Qadree, Johan Israelian, Anna Orlova, Tobias Suske, Hà Phạm, Auke Boersma, Simone Tangermann, Lukas Kenner, Thomas Rülicke, Aiping Dong, Manimekalai Ravichandran, Peter J. Brown, Gerald F. Audette, Sarah Rauscher, Sirano Dhe‐Paganon, Richard Moriggl, Patrick T. Gunning

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensDairy Farmers of OntarioStructural Genomics ConsortiumYork UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaWestern Economic Diversification CanadaÖsterreichische ForschungsförderungsgesellschaftMitacsOffice of ScienceAustrian Science FundCanadian Cancer Society Research InstituteCanada Research ChairsCanadian Cancer SocietyGovernment of CanadaCanada Foundation for InnovationOntario Research FoundationCanadian Institutes of Health ResearchCompute CanadaUniversity of SaskatchewanNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Light SourceArgonne National LaboratoryU.S. Department of Energy
Mots-clésCancer researchMutationMutantCell biologyBiologyComputational biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hyper-activated STAT5B variants are high value oncology targets for pharmacologic intervention. STAT5B N642H , a frequently-occurring oncogenic driver mutation, promotes aggressive T-cell leukemia/lymphoma in patient carriers, although the molecular origins remain unclear. Herein, we emphasize the aggressive nature of STAT5B N642H in driving T-cell neoplasia upon hematopoietic expression in transgenic mice, revealing evidence of multiple T-cell subset organ infiltration. Notably, we demonstrate STAT5B N642H -driven transformation of γδ T-cells in in vivo syngeneic transplant models, comparable to STAT5B N642H patient γδ T-cell entities. Importantly, we present human STAT5B and STAT5B N642H crystal structures, which propose alternative mutation-mediated SH2 domain conformations. Our biophysical data suggests STAT5B N642H can adopt a hyper-activated and hyper-inactivated state with resistance to dephosphorylation. MD simulations support sustained interchain cross-domain interactions in STAT5B N642H , conferring kinetic stability to the mutant anti-parallel dimer. This study provides a molecular explanation for the STAT5B N642H activating potential, and insights into pre-clinical models for targeted intervention of hyper-activated STAT5B.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,759
Score d'incertitude au seuil0,687

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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