Mode of Action Classifications in the EnviroTox Database: Development and Implementation of a Consensus MOA Classification
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Multiple mode of action (MOA) frameworks have been developed in aquatic ecotoxicology, mainly based on fish toxicity. These frameworks provide information on a key determinant of chemical toxicity, but the MOA categories and level of specificity remain unique to each of the classification schemes. The present study aimed to develop a consensus MOA assignment within EnviroTox, a curated in vivo aquatic toxicity database, based on the following MOA classification schemes: Verhaar (modified) framework, Assessment Tool for Evaluating Risk, Toxicity Estimation Software Tool, and OASIS. The MOA classifications from each scheme were first collapsed into one of 3 categories: non-specifically acting (i.e., narcosis), specifically acting, or nonclassifiable. Consensus rules were developed based on the degree of concordance among the 4 individual MOA classifications to attribute a consensus MOA to each chemical. A confidence rank was also assigned to the consensus MOA classification based on the degree of consensus. Overall, 40% of the chemicals were classified as narcotics, 17% as specifically acting, and 43% as unclassified. Sixty percent of chemicals had a medium to high consensus MOA assignment. When compared to empirical acute toxicity data, the general trend of specifically acting chemicals being more toxic is clearly observed for both fish and invertebrates but not for algae. EnviroTox is the first approach to establishing a high-level consensus across 4 computationally and structurally distinct MOA classification schemes. This consensus MOA classification provides both a transparent understanding of the variation between MOA classification schemes and an added certainty of the MOA assignment. In terms of regulatory relevance, a reliable understanding of MOA can provide information that can be useful for the prioritization (ranking) and risk assessment of chemicals. Environ Toxicol Chem 2019;38:2294-2304. © 2019 The Authors. Environmental Toxicology and Chemistry published by Wiley Periodicals, Inc. on behalf of SETAC.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle