Specific basic patch‐dependent multimerization of <i>Saccharomyces cerevisiae</i> ORC on single‐stranded DNA promotes ATP hydrolysis
Notice bibliographique
Résumé
Replication initiation at specific genomic loci dictates precise duplication and inheritance of genetic information. In eukaryotic cells, ATP-bound origin recognition complexes (ORCs) stably bind to double-stranded (ds) DNA origins to recruit the replicative helicase onto the origin DNA. To achieve these processes, an essential region of the origin DNA must be recognized by the eukaryotic origin sensor (EOS) basic patch within the disordered domain of the largest ORC subunit, Orc1. Although ORC also binds single-stranded (ss) DNA in an EOS-independent manner, it is unknown whether EOS regulates ORC on ssDNA. We found that, in budding yeast, ORC multimerizes on ssDNA in vitro independently of adenine nucleotides. We also found that the ORC multimers form in an EOS-dependent manner and stimulate the ORC ATPase activity. An analysis of genomics data supported the idea that ORC-ssDNA binding occurs in vivo at specific genomic loci outside of replication origins. These results suggest that EOS function is differentiated by ORC-bound ssDNA, which promotes ORC self-assembly and ATP hydrolysis. These mechanisms could modulate ORC activity at specific genomic loci and could be conserved among eukaryotes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».