MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2953561286 · doi:10.1158/1538-7445.am2019-2623

Abstract 2623: Modulating native GABAA receptors in medulloblastoma with positive allosteric benzodiazepine-derivatives induces cell death

2019· article· en· W2953561286 sur OpenAlexaff
Laura Kallay, Havva Keskin, Alexandra Ross, Manali Rupji, Olivia A. Moody, Xin Wang, Guanguan Li, Taukir Ahmed, Farjana Rashid, Michael Rajesh Stephen, Kirsten A. Cottrill, Austin Nuckois, Maxwell Xu, Deborah E. Martinson, Frank Tranghese, Yanxin Pei, James M. Cook, Jeanne Kowalski, Michael D. Taylor, Andrew Jenkins, Daniel Pomeranz Krummel, Soma Sengupta

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaAllosteric regulationGABAA receptorCancer researchBiologyReceptorBenzodiazepinePharmacologyChemistryInternal medicineMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pediatric brain cancer medulloblastoma standard-of-care results in numerous comorbidities. Medulloblastoma is comprised of four molecular subgroups. Group 3 subgroup patients have the highest relapse rates and 20% survival after standard-of-care. Group 3 tumors have high expression of GABRA5, which codes for the α5 subunit of the γ-aminobutyric acid type A receptor (GABAAR). We are advancing a therapeutic approach for group 3 based on GABAAR modulation using benzodiazepine-derivatives. We performed analysis of GABR and MYC expression in medulloblastoma tumors and used molecular, cell biological, and whole-cell electrophysiology approaches to establish presence of a functional ‘druggable’ GABAAR in group 3 cells. Analysis of expression of 763 medulloblastoma tumors reveals that group 3 tumors share high subgroup-specific and correlative expression of GABR genes, which code for GABAAR subunits α5, β3 and γ2 and 3. There are ~1000 functional α5-GABAARs per group 3 patient-derived cell that mediate a basal chloride-anion efflux of 2x109 ions/sec. Benzodiazepines, designed to prefer α5-GABAAR, impair group 3 cell viability by enhancing chloride-anion efflux with subtle changes in their structure having significant impact on potency. A potent, non-toxic benzodiazepine (‘KRM-II-08’) binds to the α5-GABAAR (0.8 μM EC50) enhancing a chloride-anion efflux that induces mitochondrial membrane depolarization and in response, TP53 upregulation and p53, constitutively phosphorylated at S392, cytoplasmic localization. This correlates with pro-apoptotic Bcl-2-associated death promoter (BAD) protein localization. GABR expression can serve as a diagnostic biomarker for group 3 tumors, while α5-GABAAR is a therapeutic target for benzodiazepine binding, enhancing an ion imbalance that induces apoptosis. Citation Format: Laura Kallay, Havva Keskin, Alexandra Ross, Manali Rupji, Olivia A. Moody, Xin Wang, Guanguan Li, Taukir Ahmed, Farjana Rashid, Michael Rajesh Stephen, Kirsten A. Cottrill, Austin Nuckois, Maxwell Xu, Deborah E. Martinson, Frank Tranghese, Yanxin Pei, James M. Cook, Jeanne Kowalski, Michael D. Taylor, Andrew Jenkins, Daniel Pomeranz Krummel, Soma Sengupta. Modulating native GABAA receptors in medulloblastoma with positive allosteric benzodiazepine-derivatives induces cell death [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 2623.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetNeuroscience and Neuropharmacology Research→Travaux en français237 207→