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Enregistrement W2954256702 · doi:10.1038/s41598-019-45823-7

Genome-wide Association Study of Change in Fasting Glucose over time in 13,807 non-diabetic European Ancestry Individuals

2019· article· en· W2954256702 sur OpenAlexaff
Ching‐Ti Liu, Jordi Merino, Denis Rybin, Daniel DiCorpo, Kelly S. Benke, Jennifer L. Bragg‐Gresham, Mickaël Canouil, Tanguy Corre, Harald Grallert, Aaron Isaacs, Zoltán Kutalik, Jari Lahti, Letizia Marullo, Carola Marzi, Laura J. Rasmussen‐Torvik, Ghislain Rocheleau, Rico Rueedi, Chiara Scapoli, Niek Verweij, Nicole Vogelzangs, Sara M. Willems, Loïc Yengo, Stephan J. L. Bakker, John Beilby, Jennie Hui, Eero Kajantie, Martina Müller‐Nurasyid, Wolfgang Rathmann, Beverley Balkau, Sven Bergmann, Johan G. Eriksson, José C. Florez, Philippe Froguel, Tamara Harris, Joseph Hung, Maryam Kavousi, Iva Miljkovic, Arthur W. Musk, Lyle J. Palmer, Annette Peters, Ronan Roussel, Pim van der Harst, Cornelia M. van Duijn, Péter Vollenweider, Inês Barroso, Inga Prokopenko, Josée Dupuis, James B. Meigs, Nabila Bouatia‐Naji

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Health and Medical Research CouncilSchool of Medicine, Boston UniversityEuropean CommissionNovartis PharmaFédération Française de CardiologieAssociation Diabète Risque VasculaireNovo Nordisk FondenChinese Society of Clinical OncologyHorizon 2020 Framework ProgrammeFondation de FranceNovo NordiskNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekZonMwNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungErasmus Medisch CentrumHealthwayNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSanofiNational Science FoundationLes Laboratories Pierre FabreInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleGlaxoSmithKlineEli Lilly and Company
Mots-clésGenome-wide association studyAssociation (psychology)Fasting glucoseMedicineDiabetes mellitusGenetic associationBiologyDemographyBioinformaticsGeneticsEndocrinologySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypeInsulin resistancePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Type 2 diabetes (T2D) affects the health of millions of people worldwide. The identification of genetic determinants associated with changes in glycemia over time might illuminate biological features that precede the development of T2D. Here we conducted a genome-wide association study of longitudinal fasting glucose changes in up to 13,807 non-diabetic individuals of European descent from nine cohorts. Fasting glucose change over time was defined as the slope of the line defined by multiple fasting glucose measurements obtained over up to 14 years of observation. We tested for associations of genetic variants with inverse-normal transformed fasting glucose change over time adjusting for age at baseline, sex, and principal components of genetic variation. We found no genome-wide significant association (P < 5 × 10 −8 ) with fasting glucose change over time. Seven loci previously associated with T2D, fasting glucose or HbA1c were nominally (P < 0.05) associated with fasting glucose change over time. Limited power influences unambiguous interpretation, but these data suggest that genetic effects on fasting glucose change over time are likely to be small. A public version of the data provides a genomic resource to combine with future studies to evaluate shared genetic links with T2D and other metabolic risk traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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