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Enregistrement W2954596857 · doi:10.1503/jpn.180036

The Canadian Biomarker Integration Network in Depression (CAN-BIND): magnetic resonance imaging protocols

2019· article· en· W2954596857 sur OpenAlexaffvenueabout
Glenda MacQueen, Stefanie Hassel, Stephen R. Arnott, Jean Addington, Christopher R. Bowie, Signe Bray, Andrew D. Davis, Jonathan Downar, Jane A. Foster, Benício N. Frey, Benjamin I. Goldstein, Geoffrey B. Hall, Kate L. Harkness, Jacqueline K. Harris, Raymond W. Lam, Catherine Lebel, Roumen Milev, Daniel J. Müller, Sagar V. Parikh, Sakina J. Rizvi, Susan Rotzinger, Gulshan B. Sharma, Claudio N. Soares, Gustavo Turecki, Fidel Vila‐Rodriguez, Joanna Yu, Mojdeh Zamyadi, Stephen C. Strother, Sidney H. Kennedy

Notice bibliographique

RevueJournal of Psychiatry and Neuroscience · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare HamiltonMcGill UniversityBaycrest HospitalQueen's UniversityAlberta Children's HospitalDouglas Mental Health University InstituteKingston General HospitalChild, Adolescent and Family Mental HealthUniversity of CalgaryProvidence Health CareUniversity of AlbertaUniversity of British ColumbiaUniversity of TorontoHealth Sciences CentreUniversity Health NetworkVancouver Coastal HealthCentre for Addiction and Mental HealthSunnybrook Health Science CentreSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroimagingNeuropsychologyInformaticsBiomarkerDepression (economics)Functional magnetic resonance imagingModalitiesMagnetic resonance imagingMedicineCognitionPsychologyComputer scienceNeurosciencePsychiatryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies of clinical populations that combine MRI data generated at multiple sites are increasingly common. The Canadian Biomarker Integration Network in Depression (CAN-BIND; www.canbind.ca) is a national depression research program that includes multimodal neuroimaging collected at several sites across Canada. The purpose of the current paper is to provide detailed information on the imaging protocols used in a number of CAN-BIND studies. The CAN-BIND program implemented a series of platform-specific MRI protocols, including a suite of prescribed structural and functional MRI sequences supported by real-time monitoring for adherence and quality control. The imaging data are retained in an established informatics and databasing platform. Approximately 1300 participants are being recruited, including almost 1000 with depression. These include participants treated with antidepressant medications, transcranial magnetic stimulation, cognitive behavioural therapy and cognitive remediation therapy. Our ability to analyze the large number of imaging variables available may be limited by the sample size of the substudies. The CAN-BIND program includes a multimodal imaging database supported by extensive clinical, demographic, neuropsychological and biological data from people with major depression. It is a resource for Canadian investigators who are interested in understanding whether aspects of neuroimaging — alone or in combination with other variables — can predict the outcomes of various treatment modalities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,041
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,061
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,884
Score d'incertitude au seuil0,324

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0410,061
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0090,015
Études des sciences et des technologies0,0070,002
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0070,006
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0250,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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