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Enregistrement W2955329307 · doi:10.1073/pnas.1821752116

EBV infection is associated with histone bivalent switch modifications in squamous epithelial cells

2019· article· en· W2955329307 sur OpenAlexaff
Merrin Man‐Long Leong, Arthur Kwok Leung Cheung, Wei Dai, Sai Wah Tsao, Chi Man Tsang, William O. Dawson, Josephine Mun Yee Ko, Maria Li Lung

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesUniversity of Hong KongResearch Grants Council, University Grants Committee
Mots-clésBiologyHistoneDNA repairBivalent (engine)DNA mismatch repairHistone methylationHistone H2AMolecular biologyDNA damageHistone methyltransferaseCancer researchCell biologyDNA methylationDNAChemistryGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Epstein−Barr virus (EBV) infection is implicated in the development of certain cancers; however, the mechanisms by which EBV contributes to the pathogenesis of epithelial cell malignancies remains unclear. This study highlights the association of EBV infection with aberrant modifications in histone bivalent marks, H3K4me3 and H3K27me3, in nasopharyngeal epithelial cells. Down-regulation of the DNA damage repair pathway genes, including MLH1 , associated with aberrant histone bivalent marks in a promoter hypermethylation-independent manner, was observed after EBV infection. This finding provides strong evidence linking EBV infection to epigenetic modifications in epithelial cells. This study also suggests that the level of MLH1 may be useful as a potential biomarker to evaluate the responsiveness of nasopharyngeal carcinoma patients to cisplatin-based therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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