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Enregistrement W2956685042 · doi:10.1101/703678

PGC-1α isoforms coordinate to balance hepatic metabolism and apoptosis in inflammatory environments

2019· preprint· en· W2956685042 sur OpenAlexafffund
Mélissa Léveillé, Aurèle Besse‐Patin, Nathalie Jouvet, Aysim Güneş, Stewart Jeromson, Naveen Khan, Sarah Sczelecki, Cindy Baldwin, Annie Dumouchel, Jorge C. Correia, Paulo R. Jannig, Jonathan Boulais, Jorge L. Ruas, Jennifer L. Estall

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchDiabetes CanadaVetenskapsrådetKarolinska InstitutetInternational Development Research Centre
Mots-clésInflammationBiologyCell biologyApoptosisProgrammed cell deathSignal transductionImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Liver is regularly exposed to changing metabolic and inflammatory environments. It must sense and adapt to metabolic need while balancing resources required to protect itself from insult. PGC-1α is a transcriptional coactivator that both coordinates metabolic adaptation to diverse stimuli and protects against inflammation. However, it is not known how PGC-1α integrates extracellular signals to balance metabolic and anti-inflammatory outcomes. PGC-1α exists as multiple, alternatively spliced variants expressed from different promoters. Primary mouse hepatocytes were used to evaluate the role(s) of different PGC-1α proteins in regulating hepatic metabolism and inflammatory signaling downstream of TNFα. PGC-1α1 and PGC-1α4 were expressed in hepatocytes and expression analysis uncovered shared and isoform-specific roles for these variants linked to metabolism and inflammation. PGC-1α1 primarily impacted gene programs of nutrient and mitochondrial metabolism, while TNFα signaling revealed that PGC-1α4 influenced several pathways related to innate immunity and cell death. Gain- and loss-of-function models illustrated that PGC-1α4 uniquely enhanced expression of anti-apoptotic gene programs and attenuated hepatocyte apoptosis in response to TNFα or LPS. This was in contrast to PGC-1α1, which reduced the expression of a wide inflammatory gene network, but did not prevent liver cell death in response to the cytokine. We conclude that PGC-1α variants have distinct, yet complimentary roles in hepatic responses to metabolism and inflammation and identify PGC-1α4 as an important mitigator of apoptosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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