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Enregistrement W2957751531 · doi:10.1101/699645

Insight into mosquito GnRH-related neuropeptide receptor specificity revealed through analysis of naturally occurring and synthetic analogs of this neuropeptide family

2019· preprint· en· W2957751531 sur OpenAlexafffund
Azizia Wahedi, Gerd GÄde, Jean‐Paul Paluzzi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesUniversity of Cape TownNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Research, Innovation and ScienceNational Research Foundation
Mots-clésAdipokinetic hormoneAsparagineAspartic acidReceptorBiochemistrySerineBiologyAmino acidAlanineLigand (biochemistry)Neuropeptide Y receptorPeptideNeuropeptideG protein-coupled receptorChemistryStereochemistryPhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Adipokinetic hormone (AKH), corzazonin (CRZ) and the AKH/CRZ-related peptide (ACP) are peptides considered homologous to the vertebrate gonadotropin-releasing hormone (GnRH). All three Aedes aegypti GnRH-related neuropeptide receptors have been characterized and functionally deorphanized, which individually exhibit high specificity for their native ligands, which prompted us to investigate the contribution of ligand structures in conferring receptor specificity. In the current study, we designed a series of analogs based on the native ACP sequence in A. aegypti and screened them against the ACP receptor using a heterologous system to identify critical residues required for receptor activation. Specifically, analogs lacking the carboxy-terminal amidation, replacing aromatic residues, as well as truncated analogs were either completely inactive or had very low activities even at high concentration. The next most critical residues were the polar threonine in position 3 and the blocked amino-terminal pyroglutamate, with activity of the latter partially recovered using an alternatively blocked analog. ACP analogs with alanine substitutions at position 2 (valine), 5 (serine), 6 (arginine) and 7 (aspartic acid) positions were less detrimental as were replacements of charged residues. Interestingly, replacing asparagine with an alanine at position 9, creating a C-terminal WAA-amide, resulted in a 5-fold more active analog which may be useful as a lead superagonist compound. Similarly, we utilized this high-throughput approach against an A. aegypti AKH receptor (AKHR-IA) testing a number of mostly naturally-occurring AKH analogs from other insects to determine how substitutions of specific amino acids in the AKH ligand influences receptor activation. AKH analogs having single substitutions compared to the endogenous A. aegypti AKH revealed position 7 (serine) was well tolerated whereas changes to position 6 (proline) had pronounced effects, with receptor activity compromised nearly ten-fold. Substitution of position 3 (threonine) or analogs with combinations of substitutions were quite detrimental with a significant decrease in AKHR-IA activation. Interestingly, analogs with an asparagine residue at position seven displayed improved receptor activation compared to the native mosquito AKH. Collectively, these results advance our understanding of how two GnRH-related systems in A. aegypti sharing the most recent evolutionary origin sustain independence of function and signalling despite their relatively high degree of ligand and receptor homology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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