Unveiling subgroups of 16SrIII phytoplasmas affecting Trillium sp. and Melothria pendula in Brazil and Canada
Notice bibliographique
Résumé
Melothria pendula and Trillium spp. are important weed species in Brazil and Canada. M. pendula plants showing symptoms of chlorosis, little leaf and leaf malformation and T. grandiflorum and T. erectum exhibiting virescence were tested for phytoplasma presence by nested PCR with primers that amplify the 16S rRNA, ribosomal protein, and secA genes, and subjected to RFLP and sequencing analyses. A phytoplasma of group 16SrIII was identified from M. pendula and classified as a new variant of subgroup 16SrIII-U. The 16SrIII phytoplasmas, first reported in T. grandiflorum and T. erectum in Ontario in 2016 were classified as members of the subgroup 16SrIII-F. Besides, one strain from each Trillium species examined, corresponded to a new variant of subgroup 16SrIII-F (for T. grandiflorum) and a new variant of subgroup 16SrIII-J (for T. erectum). Results refer to the first report of a phytoplasma affecting M. pendula, and the identification of new variants of 16SrIII phytoplasma subgroups in Melothria and Trillium species, which may pose a threat for the spread of 16SrIII phytoplasmas to other plant species grown nearby.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».