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Enregistrement W2963530303 · doi:10.1137/18m1222338

The Linear Stability of Symmetric Spike Patterns for a Bulk-Membrane Coupled Gierer--Meinhardt Model

2019· article· en· W2963530303 sur OpenAlexafffund
Daniel Gomez, Michael J. Ward, Juncheng Wei

Notice bibliographique

RevueSIAM Journal on Applied Dynamical Systems · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueNonlinear Dynamics and Pattern Formation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEigenvalues and eigenvectorsReaction–diffusion systemPhysicsMathematical analysisLinear stabilityThermal diffusivityNonlinear systemMathematicsThermodynamicsQuantum mechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We analyze a coupled bulk-membrane PDE model in which a scalar linear 2-D bulk diffusion process is coupled through a linear Robin boundary condition to a two-component 1-D reaction-diffusion (RD) system with Gierer--Meinhardt (nonlinear) reaction kinetics defined on the domain boundary. For this coupled model, in the singularly perturbed limit of a long-range inhibition and short-range activation for the membrane-bound species, asymptotic methods are used to analyze the existence of localized steady-state multispike membrane-bound patterns and to derive a nonlocal eigenvalue problem (NLEP) characterizing the $\mathcal{O}(1)$ time-scale instabilities of these patterns. A central, and novel, feature of this NLEP is that it involves a membrane Green's function that is coupled nonlocally to a bulk Green's function. When the domain is a disk, or in the well-mixed shadow-system limit corresponding to an infinite bulk diffusivity, this Green's function problem is analytically tractable, and as a result we will use a hybrid analytical-numerical approach to determine unstable spectra of this NLEP. This analysis characterizes how the 2-D bulk diffusion process and the bulk-membrane coupling modify the well-known linear stability properties of steady-state spike patterns for the 1-D Gierer--Meinhardt model in the absence of coupling. In particular, phase diagrams in parameter space for our coupled model characterizing either oscillatory instabilities due to Hopf bifurcations or competition instabilities due to zero-eigenvalue crossings are constructed. Finally, linear stability predictions from the NLEP analysis are confirmed with full numerical finite element simulations of the coupled PDE system. We remark that our approach is valid in more general settings than the disk or the well-mixed shadow system, with the key hurdle being the computation of the relevant Green's functions. By restricting our detailed analysis to these two specialized cases, we can bypass the computational challenges of calculating the Green's functions and therefore focus instead on the novel effects of coupling on the construction and stability of multispike solutions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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