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Enregistrement W2964457955 · doi:10.1016/j.biopsych.2019.06.031

Classical Human Leukocyte Antigen Alleles and C4 Haplotypes Are Not Significantly Associated With Depression

2019· review· en· W2964457955 sur OpenAlexafffund
Kylie P. Glanville, Jonathan R. I. Coleman, Ken B. Hanscombe, Jack Euesden, Shing Wan Choi, Kirstin L. Purves, Gerome Breen, Tracy Air, Till F. M. Andlauer, Bernhard T. Baune, Elisabeth B. Binder, Douglas Blackwood, Dorret I. Boomsma, Henriette N. Buttenschøn, Lucía Colodro‐Conde, Udo Dannlowski, Neşe Direk, Erin C. Dunn, Andreas J. Forstner, Eco J. C. de Geus, Hans J. Grabe, Steven P. Hamilton, Ian Jones, Lisa Jones, James A. Knowles, Zoltán Kutalik, Douglas F. Levinson, Glyn Lewis, Penelope A. Lind, Susanne Lucae, Patrik K. E. Magnusson, Peter McGuffin, Andrew M. McIntosh, Yuri Milaneschi, Ole Mors, Sara Mostafavi, Bertram Müller‐Myhsok, Nancy L. Pedersen, Brenda W.J.H. Penninx, James B. Potash, Martin Preisig, Stephan Ripke, Jianxin Shi, Stanley I. Shyn, Jordan W. Smoller, Fabian Streit, Patrick F. Sullivan, Henning Tiemeier, Rudolf Uher, Sandra Van der Auwera, Myrna M. Weissman, Naomi R. Wray, Manuel Mattheisen, Maciej Trzaskowski, Enda M. Byrne, Abdel Abdellaoui, Mark J. Adams, Esben Agerbo, Silviu‐Alin Bacanu, Marie Bækvad‐Hansen, Aartjan T.F. Beekman, Tim B. Bigdeli, Julien Bryois, Jonas Bybjerg‐Grauholm, Na Cai, Enrique Castelao, Jane Christensen, Toni‐Kim Clarke, Baptiste Couvy‐Duchesne, Nick Craddock, Gregory E. Crawford, Gail Davies, Ian J. Deary, Franziska Degenhardt, Eske M. Derks, Conor V. Dolan, Thalia C. Eley, Valentina Escott‐Price, Farnush Farhadi Hassan Kiadeh, Hilary K. Finucane, Jerome C. Foo, Josef Frank, Héléna A. Gaspar, Michael Gill, Fernando S. Goes, Scott D. Gordon, Jakob Grove, Lynsey S. Hall, Christine Søholm Hansen, Thomas Folkmann Hansen, Stefan Herms, Ian B. Hickie, Per Hoffmann, Georg Homuth, Carsten Horn, Jouke‐Jan Hottenga, David M. Hougaard, David M. Howard, Marcus Ising, Rick Jansen, Eric Jorgenson, Isaac S. Kohane, Julia Kraft, Warren W. Kretzschmar, Yihan Li, Donald J. MacIntyre, Dean F. MacKinnon, Robert Maier, Wolfgang Maier, Jonathan Marchini, Hamdi Mbarek, Patrick J. McGrath, Sarah E. Medland, Divya Mehta, Christel M. Middeldorp, Evelin Mihailov, Lili Milani, Francis M. Mondimore, Grant W. Montgomery, Niamh Mullins, Matthias Nauck, Bernard Ng, Michel G. Nivard, Dale R. Nyholt, Paul F. O’Reilly, Högni Óskarsson, Michael J. Owen, Jodie N. Painter, Carsten Bøcker Pedersen, Marianne Giørtz Pedersen, Roseann E. Peterson, Erik Pettersson, Wouter J. Peyrot, Giorgio Pistis, Daniëlle Posthuma, Jorge Quiroz, Per Qvist, John P. Rice, Brien P. Riley, Margarita Rivera, Saira Saeed Mirza, Robert A. Schoevers, Eva C. Schulte, Ling Shen, Engilbert Sigurðsson, Grant Sinnamon, Johannes H. Smit, Daniel J. Smıth, Hreinn Stefánsson, Stacy Steinberg, Jana Strohmaier, Katherine E. Tansey, Henning Teismann, Alexander Teumer, Wesley Thompson, Pippa A. Thomson, Thorgeir E. Thorgeirsson, Matthew Traylor, Jens Treutlein, Vassily Trubetskoy, André G. Uitterlinden, Daniel Umbricht, Albert M. van Hemert, Alexander Viktorin, Peter M. Visscher, Yunpeng Wang, Bradley T. Webb, Shantel Weinsheimer, Jürgen Wellmann, Gonneke Willemsen, Stephanie H. Witt, Yang Wu, Hualin Simon Xi, Jian Yang, Futao Zhang, Volker Arolt, Sven Cichon, J. Raymond DePaulo, Enrico Domenici, Katharina Domschke, Tõnu Esko, Caroline Hayward, Andrew C. Heath, Kenneth S. Kendler, Stefan Kloiber, Qingqin S. Li, P.A. Madden, Nicholas G. Martin, Andres Metspalu, Preben Bo Mortensen, Bertram Müller-Myhsok, Merete Nordentoft, Markus M. Nöthen, Michael O‘Donovan, Sara A. Paciga, Roy H. Perlis, David J. Porteous, Marcella Rietschel, Catherine Schaefer, Thomas G. Schulze, Henry Völzke, Thomas Werge, Cathryn M. Lewis, Anders D. Børglum

Notice bibliographique

RevueBiological Psychiatry · 2019
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCilagNational Institute of Mental HealthNHLBI Division of Intramural ResearchInstitute of Molecular and Cell BiologyNational Health and Medical Research CouncilStanley Center for Psychiatric Research, Broad InstituteUniversity of North Carolina at Chapel HillSchool of Medicine, Emory UniversityNational Institutes of HealthNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismCentre for Cognitive Ageing and Cognitive EpidemiologyH. Lundbeck A/SInnovative Medicines InitiativeChinese Society of Clinical OncologyMedical Research CouncilSiemens HealthineersTartu ÜlikoolLeids Universitair Medisch CentrumWestfälische Wilhelms-Universität MünsterDokuz Eylül ÜniversitesiVetenskapsrådetMedizinische Fakultät der Albert-Ludwigs-Universität FreiburgGGZ DrenthePfizerRivierduinenGGZ inGeestGentofte HospitalDeutsche ForschungsgemeinschaftNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekHáskóli ÍslandsBundesministerium für Bildung und ForschungErasmus Medisch CentrumVrije Universiteit AmsterdamJanssen Research and DevelopmentZonMwRijksuniversiteit GroningenSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversiteit LeidenUniversity of TorontoInstitute of GeneticsDepartment of Psychiatry, University of TorontoUniversität GreifswaldGGZ FrieslandNational Cancer InstituteUniversity College LondonLundbeckfondenAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgMax-Planck-GesellschaftKing's College LondonDepartment of Health and Social CareRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnUniversitair Medisch Centrum GroningenUniversità degli Studi di TrentoVirginia Commonwealth UniversityPhilipps-Universität MarburgAarhus UniversitetUniversität BaselQIMR Berghofer Medical Research InstituteHøjteknologifondenJohns Hopkins UniversityNational Institute for Health and Care ResearchAarhus UniversitetshospitalUniversity of Southern CaliforniaFoundation for the National Institutes of HealthBroad InstituteF. Hoffmann-La RocheDalhousie UniversityGlaxoSmithKlineUniversitätsmedizin GöttingenQueensland Brain InstituteKarolinska InstitutetUniversity of QueenslandEmory UniversityCardiff UniversityKaiser PermanenteWellcome TrustNational Science FoundationMassachusetts General HospitalAstraZenecaUniversity of Worcester
Mots-clésHuman leukocyte antigenHaplotypeMajor histocompatibility complexAlleleOdds ratioDepression (economics)GeneticsImmunologyBiologyMedicineInternal medicineGeneAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The prevalence of depression is higher in individuals with autoimmune diseases, but the mechanisms underlying the observed comorbidities are unknown. Shared genetic etiology is a plausible explanation for the overlap, and in this study we tested whether genetic variation in the major histocompatibility complex (MHC), which is associated with risk for autoimmune diseases, is also associated with risk for depression. METHODS: ). RESULTS: No HLA alleles or C4 haplotypes were associated with depression at the region-wide threshold. HLA-B*08:01 was associated with modest protection for depression at the candidate threshold for testing in HLA genes in the meta-analysis (odds ratio = 0.98, 95% confidence interval = 0.97-0.99). CONCLUSIONS: We found no evidence that an increased risk for depression was conferred by HLA alleles, which play a major role in the genetic susceptibility to autoimmune diseases, or C4 haplotypes, which are strongly associated with schizophrenia. These results suggest that any HLA or C4 variants associated with depression either are rare or have very modest effect sizes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,901
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,152
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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