Adverse Outcome Pathway on Aryl hydrogen receptor activation leading to uroporphyria
Notice bibliographique
Résumé
Hepatic uroporphyria is a disorder where the disturbance of heme biosynthesis results in accumulation and excretion of uroporphyrin, heptacarboxyl- and hexacarboxyl porphyrin: collectively referred to as highly carboxylated porphyrins (HCPs). The disorder is due to a homozygous mutation in uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), an enzyme involved in the heme biosynthesis pathway, or may be chemically induced, which involves the inhibition of UROD. This AOP describes the linkages leading to chemically induced porphyria through the activation of the aryl hydrocarbon receptor (AHR), a ligand-activated transcription factor. AHR activation leads to the induction of cytochrome P450 1A2, a phase I metabolising enzyme, which in turn results in excessive oxidation of uroporphyrinogen. This oxidation produces a UROD inhibitor, preventing the conversion of uroporphyrinogen to coprouroporphyrinogen and increasing the synthesis of the UROD inhibitor in a positive feedback loop. The accumulation of uroporphyrinogen leads to its preferential oxidation and accumulation of HCP in various organs (Uroporphyria).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,071 | 0,030 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».