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Enregistrement W2966222235 · doi:10.1787/fde13d2c-en

Adverse Outcome Pathway on Aryl hydrogen receptor activation leading to uroporphyria

2019· paratext· en· W2966222235 sur OpenAlexaff
Amani Farhat, Gillian E. Manning, Jason M. O’Brien, Sean W. Kennedy

Notice bibliographique

RevueOECD series on adverse outcome pathways · 2019
Typeparatext
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUroporphyrinogen III decarboxylaseAryl hydrocarbon receptorHemeChemistryCytochrome P450EnzymePorphyriaArylLigand (biochemistry)StereochemistryBiochemistryReceptorTranscription factorBiologyEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hepatic uroporphyria is a disorder where the disturbance of heme biosynthesis results in accumulation and excretion of uroporphyrin, heptacarboxyl- and hexacarboxyl porphyrin: collectively referred to as highly carboxylated porphyrins (HCPs). The disorder is due to a homozygous mutation in uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), an enzyme involved in the heme biosynthesis pathway, or may be chemically induced, which involves the inhibition of UROD. This AOP describes the linkages leading to chemically induced porphyria through the activation of the aryl hydrocarbon receptor (AHR), a ligand-activated transcription factor. AHR activation leads to the induction of cytochrome P450 1A2, a phase I metabolising enzyme, which in turn results in excessive oxidation of uroporphyrinogen. This oxidation produces a UROD inhibitor, preventing the conversion of uroporphyrinogen to coprouroporphyrinogen and increasing the synthesis of the UROD inhibitor in a positive feedback loop. The accumulation of uroporphyrinogen leads to its preferential oxidation and accumulation of HCP in various organs (Uroporphyria).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,505
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,072

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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