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Enregistrement W2966514307 · doi:10.1101/cshperspect.a038265

Organellar Calcium Handling in the Cellular Reticular Network

2019· review· en· W2966514307 sur OpenAlexafffund
Wen‐An Wang, Luis B. Agellon, Marek Michalak

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Perspectives in Biology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalcium signaling and nucleotide metabolism
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyEndoplasmic reticulumCell biologyGolgi apparatusEndocytic cycleOrganelleCalcium signalingMembrane contact siteEndomembrane systemSecond messenger systemCellular compartmentReticular connective tissueIntracellularCellMembrane proteinBiochemistryEndocytosisMembraneAnatomyIntegral membrane protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ca 2+ is an important intracellular messenger affecting diverse cellular processes.In eukaryotic cells, Ca 2+ is handled by a myriad of Ca 2+ -binding proteins found in organelles that are organized into the cellular reticular network (CRN).The network is comprised of the endoplasmic reticulum, Golgi apparatus, lysosomes, membranous components of the endocytic and exocytic pathways, peroxisomes, and the nuclear envelope.Membrane contact sites between the different components of the CRN enable the rapid movement of Ca 2+ , and communication of Ca 2+ status, within the network.Ca 2+ -handling proteins that reside in the CRN facilitate Ca 2+ sensing, buffering, and cellular signaling to coordinate the many processes that operate within the cell. INTRACELLULAR Ca 2+ DYNAMICS AND THE CELLULAR RETICULAR NETWORKC a 2+ is a universal signaling ion involved in the regulation of numerous processes throughout the lifetime of the cell and the organism (Krebs et al. 2015;Berridge 2016).Inside the cell, the resting free Ca 2+ concentration and Ca 2+ -signaling pathways must be tightly regulated because of the integral role of Ca 2+ in nearly all aspects of cell physiology (Baumann and Walz 2001;Groenendyk et al. 2013;Krebs et al. 2015;Nunes-Hasler and Demaurex 2017;Prudent and McBride 2017).Cytoplasmic Ca 2+ is maintained at a resting concentration that is two to three orders of magnitude lower than the extracellular free Ca 2+ concentration (Krebs et al. 2015;Berridge 2016).This markedly lower cytoplasmic free Ca 2+ concentration is maintained by action of Ca 2+ -handling proteins and the reticular network of intracellular membrane systems (Fig. 1) that comprise the endoplasmic reticulum (ER), sarcoplasmic reticulum (SR), Golgi apparatus, lysosomes, membranous components of the endocytic pathway, peroxisomes, and nuclear envelope (Prins and Michalak 2011;Krebs et al. 2015;Berridge 2016).This intracellular network of specialized membrane systems, the cellular reticular network (CRN), is linked together to facilitate and coordinate cellular function.The organelles of the CRN accumulate and store Ca 2+ and maintain the Ca 2+ stores at a higher concentration (mM) than that of cytoplasmic Ca 2+ .The ER is the dominating com-

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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