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Enregistrement W2967809013 · doi:10.22215/etd/2015-11219

Increasing the Sensitivity of Phospholipid Analyses from Biological Extracts via Trimethylation Enhancement using Diazomethane (TrEnDi) and Tandem Mass Spectrometry

2015· dissertation· en· W2967809013 sur OpenAlexafffund
Carlos Canez Quijada

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesGovernment of Ontario
Mots-clésDiazomethaneChemistryChromatographyTandem mass spectrometryDerivatizationPhosphatidylethanolaminePhospholipidMass spectrometryDetection limitLiquid chromatography–mass spectrometryPhosphatidylcholineBiochemistryOrganic chemistryMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TrEnDi is a novel rapid in-solution technique for quaternization of phospholipid amino groups and methylation of phosphate groups via reaction with diazomethane and tetrafluoroboric acid. TrEnDi significantly enhanced the sensitivity of mass spectrometry and tandem MS studies of phosphatidylethanolamine, phosphatidylserine, phosphatidylcholine and sphingomyelin standards. Use of 13C-diazomethane enabled creation of independent precursor ion scans (PIS) for modified PE and modified PC species which would otherwise can produce undistinguishable isobaric species. The efficacy of the technique was tested on a complex biological sample. 13C-TrEndi provided a drastic sensitivity enhancement for PE and PS species enabling the identification and quantitation of several species which were below the limit of detection and quantitation prior to modification. Derivatization provided a modest sensitivity enhancement for PC species and allowed quantitation of several PC species that were below the limit of quantitation prior to modification. SM species exhibited neither sensitivity increase nor hindrance after modification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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