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Enregistrement W2968755345 · doi:10.1002/gepi.22242

Genetic overlap between autoimmune diseases and non‐Hodgkin lymphoma subtypes

2019· article· en· W2968755345 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenetic Epidemiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaMcGill University Health CentreCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreSimon Fraser UniversityBC Cancer AgencyUniversity of CalgaryMcGill University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Chronic Disease Prevention and Health PromotionNational Institute of Environmental Health SciencesUtah Department of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Human Genome Research InstituteMedical Research CouncilNational Institutes of HealthBlood Cancer UKNational Institute for Health and Care ResearchVlaamse regeringCancerfondenBundesamt für StrahlenschutzLeukemia and Lymphoma ResearchNational Health and Medical Research CouncilNational Center for Research ResourcesInstitut National Du CancerAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroUniversity of UtahFondation de FranceGeneralitat de CatalunyaCanadian Institutes of Health ResearchFonds Wetenschappelijk OnderzoekBundesministerium für Bildung und ForschungAcademy of FinlandInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMichael Smith Health Research BCNational Institute on AgingHealth Research BoardWorld Health OrganizationWellcome TrustNational Heart, Lung, and Blood InstituteMultiple Sclerosis AustraliaHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriMultiple Sclerosis SocietyDeutsche ForschungsgemeinschaftScleroseforeningenNational Natural Science Foundation of ChinaLymphoma FoundationKarolinska InstitutetUtah State UniversityHuntsman Cancer InstituteWellcomeJosé Carreras Leukämie-StiftungEuropean CommissionBiogenU.S. Department of Veterans AffairsFondation pour l'Aide à la Recherche sur la Sclérose en PlaquesU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésGenome-wide association studyLymphomaDiseaseFollicular lymphomaGenetic associationEtiologyRheumatoid arthritisOncologyMedicineImmunologyBiologyInternal medicineGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epidemiologic studies show an increased risk of non-Hodgkin lymphoma (NHL) in patients with autoimmune disease (AD), due to a combination of shared environmental factors and/or genetic factors, or a causative cascade: chronic inflammation/antigen-stimulation in one disease leads to another. Here we assess shared genetic risk in genome-wide-association-studies (GWAS). Secondary analysis of GWAS of NHL subtypes (chronic lymphocytic leukemia, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, and marginal zone lymphoma) and ADs (rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus, and multiple sclerosis). Shared genetic risk was assessed by (a) description of regional genetic of overlap, (b) polygenic risk score (PRS), (c)"diseasome", (d)meta-analysis. Descriptive analysis revealed few shared genetic factors between each AD and each NHL subtype. The PRS of ADs were not increased in NHL patients (nor vice versa). In the diseasome, NHLs shared more genetic etiology with ADs than solid cancers (p = .0041). A meta-analysis (combing AD with NHL) implicated genes of apoptosis and telomere length. This GWAS-based analysis four NHL subtypes and three ADs revealed few weakly-associated shared loci, explaining little total risk. This suggests common genetic variation, as assessed by GWAS in these sample sizes, may not be the primary explanation for the link between these ADs and NHLs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil0,922

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle