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Enregistrement W2968991328 · doi:10.1101/732339

Reversible Mitochondrial Fragmentation in iPSC-Derived Cardiomyocytes from Children with DCMA, a Mitochondrial Cardiomyopathy

2019· preprint· en· W2968991328 sur OpenAlexafffund
Leili Rohani, Pranav Machiraju, Rasha Sabouny, Guoliang Meng, Shiying Liu, Tian Zhao, Fatima Iqbal, Amir Ravandi, Joseph C. Wu, Aneal Khan, Timothy E. Shutt, Derrick E. Rancourt, Steven C. Greenway

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaHotchkiss Brain InstituteSt. Boniface HospitalAlberta Children's HospitalUniversity of ManitobaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Children's Hospital FoundationChildren's Hospital FoundationChildren's Cardiomyopathy FoundationUniversity of Calgary
Mots-clésInduced pluripotent stem cellBiologyCardiolipinMitochondrionmitochondrial fusionCell biologyMitochondrial diseaseGeneticsMitochondrial DNAGeneEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background The dilated cardiomyopathy with ataxia syndrome (DCMA) is an understudied autosomal recessive disease caused by loss-of-function mutations in the poorly characterized gene DNAJC19 . Clinically, DCMA is commonly associated with heart failure and early death in affected children through an unknown mechanism. DCMA has been linked to Barth syndrome, a rare but well-studied disorder caused by deficient maturation of cardiolipin (CL), a key mitochondrial membrane phospholipid. Methods Peripheral blood mononuclear cells from two children with DCMA and severe cardiac dysfunction were reprogrammed into induced pluripotent stem cells (iPSCs). Patient and control iPSCs were differentiated into beating cardiomyocytes (iPSC-CMs) using a metabolic selection strategy and mitochondrial structure and CL content before and after incubation with the mitochondrially-targeted peptide SS-31 were quantified. Results Patient iPSCs carry the causative DNAJC19 mutation (rs137854888) found in the Hutterite population and the iPSC-CMs demonstrated highly fragmented and abnormally-shaped mitochondria associated with an imbalanced isoform ratio of the mitochondrial protein OPA1, an important regulator of mitochondrial fusion. These abnormalities were reversible by incubation with SS-31 for 24 hours. Differentiation of iPSCs into iPSC-CMs increased the number of CL species observed but consistent, significant differences in CL content were not seen between patients and control. Conclusions We describe a unique and novel cellular model that provides insight into the mitochondrial abnormalities present in DCMA and identifies SS-31 as a potential therapeutic for this devastating disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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