Application of Epidemiology and Biostatistics to Malaria Diagnosis in Returning Travellers
Notice bibliographique
Résumé
Today, malaria elimination is back on the agenda but for this to be feasible, there must be a coordinated global effort utilizing all available tools. Portable, sensitive diagnostics with a low limit of detection are required to detect the malaria reservoir, and novel antimalarials are required to combat the threat of artemisinin resistance. Returning travellers are a good population in which to investigate malaria physiology and diagnostics because there is a good supply of study participants and an abundance of easily available data. In Canada, a combination of microscopy and rapid diagnostic tests are used to diagnose malaria, but these lack sensitivity and require repeated testing to rule out the condition. A prospective diagnostic trial of the illumigene Malaria, loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay, manufactured by Meridian Bioscience was conducted in symptomatic returning travellers between June 2017 and January 2018. After discrepant resolution with RT-PCR, LAMP had a sensitivity of 100% (95% CI; 95.8-100) and a specificity of 100% (95% CI; 98.7-100). In symptomatic returning travellers, LAMP has the potential to replace traditional malaria diagnostics, allowing for malaria to be ruled out in a timely manner. It is unclear if uncomplicated malaria causes deranged liver enzymes, which has implications for antimalarial drug development. A retrospective cohort study was evaluated in returning travellers (n=4548) who underwent a malaria test and had liver enzymes measured within 31 days from 2010-2017. After adjusting for gender, age, and use of hepatotoxic medications, returning travellers testing positive for malaria had higher odds of having an abnormal TB [(OR: 12.64, 95% CI: 6.32 – 25.29), p<0.001] but not ALP [(OR: 0.32, 95% CI: 0.09 – 1.10), p=0.072], ALT [(OR: 1.01, 95% CI: 0.54 – 1.89), p=0.978] or AST [(OR: 1.26, 95% CI: 0.22 – 7.37), p=0.794], compared to those who tested negative. This is most likely to be due to haemolysis, which normalizes following treatment. LAMP can be used in the diagnosis of malaria in returning travellers, and it may have a role in malaria elimination. Uncomplicated malaria does not appear to cause raised aminotransferases in returning travellers, and consideration must be given to this in antimalarial drug development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,033 | 0,098 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».