Matrix metalloproteinase 2 (<i>MMP2</i>) polymorphism, <i>Helicobacter pylori</i> (HP) infection and esophageal adenocarcinoma (EA) risk
Notice bibliographique
Résumé
10553 Background: Epidemiologic studies suggest that HP infection protects against EA risk, as HP-mediated chronic atrophic gastritis reduces acid reflux. Genetic variations may modify the host response to HP infection and alter this risk. MMP2 expression is commonly upregulated in HP infections. We hypothesize that a functional MMP2 promoter polymorphism (-C1306T) that abolishes a Sp1 binding site and decreases promoter activity will also reduce the protective effects of HP infections in EA risk. Methods: HP status was determined in 98 EA patients and 101 age and gender matched healthy controls, using a commercially available serum immunoblotting kit (Helicoblot 2.1, Genelabs Diagnostics) that measures ever, current, CagA+ and VacA+ HP infections. Genotyping was performed using TaqMan. Data were analyzed using unconditional logistic regression. Results: 39% of cases and 44% of controls (P=0.69) had MMP2 variants (T/T or C/T). 36% of cases and 42% of controls were ever HP infected (P= 0.35). In individuals carrying the MMP2 wild type (CC) genotype, ever HP infection was strongly protective against EA [Odds Ratio (OR) 0.32: 95% CI, 0.13–0.75; P=0.008]. In contrast, in individuals carrying the MMP2 variants that are associated with lower promoter activity, this protective effect was lost (OR 1.76; 95% CI, 0.06–5.2; P= 0.30). Similar results were found when evaluating the MMP2 and current, CagA or VacA infection. Statistical interactions between MMP2 genotype and ever HP infection (P=0.027) and between MMP2 genotype and VacA+ infection (P= 0.035) were significant. Conclusions: We are the first to report that host factors such as the MMP2 polymorphism modulate the role of HP infection in EA susceptibility. No significant financial relationships to disclose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».