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Enregistrement W2969786980 · doi:10.1093/infdis/jiz423

Plasma Levels of C-Type Lectin REG3α and Gut Damage in People With Human Immunodeficiency Virus

2019· article· en· W2969786980 sur OpenAlexafffund
Stéphane Isnard, Rayoun Ramendra, Franck P. Dupuy, John Lin, Brandon Fombuena, Nikola Kokinov, Ido P. Kema, Mohammad‐Ali Jenabian, Bertrand Lebouché, Cecilia T. Costiniuk, Petronela Ancuța, Nicole F. Bernard, Michael Silverman, Péter L. Lakatos, Madéleine Durand, Cécile Tremblay, Jean‐Pierre Routy, C Milne, Stephanie Lavoie, J Friedman, M Duchastel, F Villielm, F Asselin, Michel Boissonnault, Pierre-Jean Maziade, M Milne, N Z Miaki, Mathieu Thériault, Bernard Lessard, M. A. Charron, S Dufresne, Maxime Turgeon, Sylvie Vézina, Emmanuelle Huchet, J P Kerba, Marc Poliquin, Sebastien Poulin, Pierre-Alexandre Rochette, Patrice Junod, Danièle Longpré, Robert Pilarski, E Sasseville, Louise Charest, A Hamel, A Cloutier-Blais, Samuel Massoud, F Chano, Benoît Trottier, Louise G. Labrecque, Claude Fortin, V Hal-Gagne, M.J. Romero Muñoz, Benoit Deligne, Valérie Martel‐Laferrière, Marianne Goyer, Marty Teltscher, Alexandra de Pokomandy, Joseph Cox, E Beauchamp, Marina B. Klein, Louis‐Patrick Haraoui

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensWestern UniversityUniversité du Québec à MontréalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityUniversité de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésImmunologyCD8InflammationViral loadBiologyChromosomal translocationHuman immunodeficiency virus (HIV)Immune systemMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Regenerating islet-derived protein 3α (REG3α) is an antimicrobial peptide secreted by intestinal Paneth cells. Circulating REG3α has been identified as a gut damage marker in inflammatory bowel diseases. People living with human immunodeficiency virus (PWH) on antiretroviral therapy (ART) present with an abnormal intestinal landscape leading to microbial translocation, persistent inflammation, and development of non-AIDS comorbidities. Herein, we assessed REG3α as a marker of gut damage in PWH. METHODS: Plasma from 169 adult PWH, including 30 elite controllers (ECs), and 30 human immunodeficiency virus (HIV)-uninfected controls were assessed. REG3α plasma levels were compared with HIV disease progression, epithelial gut damage, microbial translocation, and immune activation markers. RESULTS: Cross-sectionally, REG3α levels were elevated in untreated and ART-treated PWH compared with controls. ECs also had elevated REG3α levels compared to controls. Longitudinally, REG3α levels increased in PWH without ART and decreased in those who initiated ART. REG3α levels were inversely associated with CD4 T-cell count and CD4:CD8 ratio, while positively correlated with HIV viral load in untreated participants, and with fungal product translocation and inflammatory markers in all PWH. CONCLUSIONS: Plasma REG3α levels were elevated in PWH, including ECs. The gut inflammatory marker REG3α may be used to evaluate therapeutic interventions and predict non-AIDS comorbidity risks in PWH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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