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Enregistrement W2969887139 · doi:10.3389/fneur.2019.00968

Expression of Human Endogenous Retrovirus-K in Spinal and Bulbar Muscular Atrophy

2019· article· en· W2969887139 sur OpenAlexafffund
Cody Rex, Marie-Josée Nadeau, Renée N. Douville, Kerri Schellenberg

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neurology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanUniversity of ManitobaUniversity of Winnipeg
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversities Space Research AssociationUniversity of WinnipegBC Children's HospitalChildren's Hospital FoundationRare Disease Foundation
Mots-clésSpinal and bulbar muscular atrophyAmyotrophic lateral sclerosisPolyglutamine tractAndrogen receptorBiologyNeurodegenerationAtrophyMotor neuronPathologyImmunologyMedicineSpinal cordDiseaseNeuroscienceGeneticsHuntington's diseaseProstate cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Spinal and Bulbar Muscular Atrophy (SBMA) is caused by the extension of the polyglutamine tract within the androgen receptor (AR) gene, and results in a multisystem presentation, including the degeneration of lower motor neurons. The androgen receptor (AR) is known to modulate the expression of endogenous retrovirus-K (ERVK), a pathogenic viral genomic symbiont. Since ERVK is associated with motor neuron disease, such as Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS), we sought to determine if patients with SBMA exhibit evidence of ERVK reactivation. Results: Data from a pilot study demonstrate that peripheral blood mononuclear cell (PBMC) samples from controls and patients with SBMA were examined ex vivo for the expression of ERVK viral transcripts and proteins. No differences in ERVK RNA expression was observed between the clinical groups. In contrast, significant enhancement of processed ERVK Gag and integrase proteins were observed in SBMA-derived PBMC as compared to healthy control specimens. Increased ERVK protein expression co-occurred with elevation in the expression of the pro-inflammatory transcription factor IRF1 in SBMA. Conclusions: Our findings indicate that ERVK expression and activity in SBMA is an unrecognized biomarker and facet of the disease. We discuss how our current understanding of ERVK-driven pathology may tie into key aspects of multi-system dysfunction in SBMA, with a focus on inflammation, proteinopathy, as well as DNA damage and repair.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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