MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2970012232 · doi:10.1161/atvbaha.119.311392

2018 George Lyman Duff Memorial Lecture

2019· article· en· W2970012232 sur OpenAlexafffund
Ruth McPherson

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensCanadian Heart Research Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGenome-wide association studyMissing heritability problemExpression quantitative trait lociGenetic architectureGenetic associationImputation (statistics)Quantitative trait locusBiologyGenomeGeneticsMendelian randomizationGenomicsComputational biologyGeneMissing dataComputer scienceGenetic variantsSingle-nucleotide polymorphismMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent studies have led to a broader understanding of the genetic architecture of coronary artery disease and demonstrate that it largely derives from the cumulative effect of multiple common risk alleles individually of small effect size rather than rare variants with large effects on coronary artery disease risk. The tools applied include genome-wide association studies encompassing over 200 000 individuals complemented by bioinformatic approaches including imputation from whole-genome data sets, expression quantitative trait loci analyses, and interrogation of ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements), Roadmap Epigenetic Project, and other data sets. Over 160 genome-wide significant loci associated with coronary artery disease risk have been identified using the genome-wide association studies approach, 90% of which are situated in intergenic regions. Here, I will describe, in part, our research over the last decade performed in collaboration with a series of bright trainees and an extensive number of groups and individuals around the world as it applies to our understanding of the genetic basis of this complex disease. These studies include computational approaches to better understand missing heritability and identify causal pathways, experimental approaches, and progress in understanding at the molecular level the function of the multiple risk loci identified and potential applications of these genomic data in clinical medicine and drug discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil0,356

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1060,074

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular BiologyMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207