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Enregistrement W2970061330 · doi:10.3390/md17090510

Extremely Potent Block of Bacterial Voltage-Gated Sodium Channels by µ-Conotoxin PIIIA

2019· article· en· W2970061330 sur OpenAlexafffund
Rocio K. Finol‐Urdaneta, Jeffrey R. McArthur, Vyacheslav S. Korkosh, Sun Huang, D. McMaster, Robert Glavica, Denis B. Tikhonov, Boris S. Zhorov, Robert J. French

Notice bibliographique

RevueMarine Drugs · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaRussian Foundation for Basic Research
Mots-clésSodium channelBiophysicsChemistrySkeletal muscleSodiumVoltage clampIC50Patch clampMembrane potentialConotoxinBiochemistryBiologyAnatomyIn vitroPeptideReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

µ-Conotoxin PIIIA, in the sub-picomolar, range inhibits the archetypal bacterial sodium channel NaChBac (NavBh) in a voltage- and use-dependent manner. Peptide µ-conotoxins were first recognized as potent components of the venoms of fish-hunting cone snails that selectively inhibit voltage-gated skeletal muscle sodium channels, thus preventing muscle contraction. Intriguingly, computer simulations predicted that PIIIA binds to prokaryotic channel NavAb with much higher affinity than to fish (and other vertebrates) skeletal muscle sodium channel (Nav 1.4). Here, using whole-cell voltage clamp, we demonstrate that PIIIA inhibits NavBac mediated currents even more potently than predicted. From concentration-response data, with [PIIIA] varying more than 6 orders of magnitude (10−12 to 10−5 M), we estimated an IC50 = ~5 pM, maximal block of 0.95 and a Hill coefficient of 0.81 for the inhibition of peak currents. Inhibition was stronger at depolarized holding potentials and was modulated by the frequency and duration of the stimulation pulses. An important feature of the PIIIA action was acceleration of macroscopic inactivation. Docking of PIIIA in a NaChBac (NavBh) model revealed two interconvertible binding modes. In one mode, PIIIA sterically and electrostatically blocks the permeation pathway. In a second mode, apparent stabilization of the inactivated state was achieved by PIIIA binding between P2 helices and trans-membrane S5s from adjacent channel subunits, partially occluding the outer pore. Together, our experimental and computational results suggest that, besides blocking the channel-mediated currents by directly occluding the conducting pathway, PIIIA may also change the relative populations of conducting (activated) and non-conducting (inactivated) states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,225
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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