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Enregistrement W2970379806 · doi:10.1038/s41467-019-11862-x

The molecular origin and taxonomy of mucinous ovarian carcinoma

2019· article· en· W2970379806 sur OpenAlexafffund
Dane Cheasley, Matthew J. Wakefield, Georgina L. Ryland, Prue E. Allan, Kathryn Alsop, Kaushalya Amarasinghe, Sumitra Ananda, Michael S. Anglesio, George Au‐Yeung, Maret Böhm, David D.L. Bowtell, Alison H. Brand, Georgia Chenevix‐Trench, Michael Christie, Yoke-Eng Chiew, Michael Churchman, Anna DeFazio, Renee Demeo, Rhiannon Dudley, Nicole Fairweather, Clare G. Fedele, Sián Fereday, Stephen B. Fox, C. Blake Gilks, Charlie Gourley, Neville F. Hacker, Alison Hadley, Joy Hendley, Gwo‐Yaw Ho, Siobhan Hughes, David G. Hunstman, Sally M. Hunter, Tom Jobling, Kimberly R. Kalli, Scott H. Kaufmann, Catherine J. Kennedy, Martin Köbel, Cécile Le Page, Jason Li, Richard Lupat, Orla McNally, Jessica N. McAlpine, Anne‐Marie Mes‐Masson, Linda Mileshkin, Diane Provencher, Jan Pyman, Kurosh Rahimi, Simone M. Rowley, Carolina Salazar, Goli Samimi, Hugo Saunders, Timothy Semple, R. Sharma, Alice J. Sharpe, Andrew N. Stephens, Niko Thio, Michelle C. Torres, Nadia Traficante, Zhongyue Xing, Magnus Zethoven, Yoland Antill, Clare L. Scott, Ian Campbell, Kylie L. Gorringe

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of CalgaryCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandCancer Council TasmaniaNational Institutes of HealthBC Cancer FoundationUniversité de MontréalCancer Council South AustraliaMedical Research CouncilPeter MacCallum FoundationTerry Fox Research InstitutePeter MacCallum Cancer CentreCancer Council VictoriaCancer AustraliaAustralian Cancer Research FoundationCancer Council NSWNational Health and Medical Research CouncilMinnesota Ovarian Cancer AllianceVGH and UBC Hospital FoundationCancer Institute NSWFred C. and Katherine B. Andersen FoundationNational Cancer InstituteOvarian Cancer AustraliaMayo Foundation for Medical Education and Research
Mots-clésOvaryOvarian cancerOvarian carcinomaAmpliconBiologyPathologyCancer researchDiseaseOncologyCancerMedicineGeneGeneticsPolymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mucinous ovarian carcinoma (MOC) is a unique subtype of ovarian cancer with an uncertain etiology, including whether it genuinely arises at the ovary or is metastatic disease from other organs. In addition, the molecular drivers of invasive progression, high-grade and metastatic disease are poorly defined. We perform genetic analysis of MOC across all histological grades, including benign and borderline mucinous ovarian tumors, and compare these to tumors from other potential extra-ovarian sites of origin. Here we show that MOC is distinct from tumors from other sites and supports a progressive model of evolution from borderline precursors to high-grade invasive MOC. Key drivers of progression identified are TP53 mutation and copy number aberrations, including a notable amplicon on 9p13. High copy number aberration burden is associated with worse prognosis in MOC. Our data conclusively demonstrate that MOC arise from benign and borderline precursors at the ovary and are not extra-ovarian metastases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,547
Score d'incertitude au seuil0,188

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations187
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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