Abstract P3003: miR-338-3p Down-Regulation Caused Up-Regulation of Alkaline Ceramidase 2 and Glutathione Peroxidase 3 mRNAs in Subcutaneous Small Arteries of Hypertensive Patients With Chronic Kidney Disease
Notice bibliographique
Résumé
Background: Hypertension (HTN) and chronic kidney disease (CKD) are associated with vascular damage characterized by vascular remodeling and stiffening and endothelial dysfunction. miRNAs are small non-coding RNA that regulate gene expression by binding to their target messenger RNAs (mRNAs), leading to mRNA degradation or translational repression. Their implication in vascular injury remains unclear. We aimed to identify differentially expressed (DE) miRs in small arteries of HTN and CKD human subjects to gain insight into pathophysiological molecular mechanisms in these conditions. Methods: Normotensive, HTN [systolic blood pressure (BP) >135 mmHg or diastolic BP of 85-115 mmHg with BpTRU] and CKD subjects (estimated glomerular filtration rate <60mL/min/m 2 ) (n=15-16) were studied. Small arteries were isolated from subcutaneous gluteal biopsies and RNA extracted for small and total RNA sequencing using Illumina HiSeq-2500 and further studied using a systems biology approach. Differentially expressed (DE) genes were identified with fold change >1.5 and fold discovery rate <0.1. Results: DE miRs were identified ( P <0.05) uniquely associated with HTN (3↑ and 6↓) or CKD (42↑ and 39↓) or both groups (2↓). Correlation between RNA-sequencing and RT-qPCR data was demonstrated for 3 of 14 tested miRs. Among them, the first-ranked, miR-338-3p ( r =0.91, P <10 -16 ), uniquely associated with CKD, was studied further. miR-338-3p and some of its predicted targets were highly expressed in human aortic endothelial cells (HAECs). Two of them, alkaline ceramidase 2 ( ACER2 ) and glutathione peroxidase 3 (GPX3), were up-regulated by ~36% and ~60% in HAECs transfected with anti-miR-338-3p, respectively ( P <0.05). miR-338-3p mimic co-transfection decreased by 30% luciferase activity of reporter vectors containing the conserved wild-type but not mutated ACER2 or GPX3 3’ untranslated transcribed region miR-338-3p-5p binding sites ( P <0.05). Conclusion: miR-338-3p was down-regulated in small arteries, which was uniquely associated with CKD. ACER2 and GPX3 , identified as miR-338-3p targets, may play a role in vascular injury in CKD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».