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Enregistrement W2972180383 · doi:10.1101/gad.328849.119

Regulation of histone methylation by automethylation of PRC2

2019· article· en· W2972180383 sur OpenAlexfundno aff
Xueyin Wang, Yicheng Long, Richard D. Paucek, Anne R. Gooding, Thomas Lee, Rachel M. Burdorf, Thomas R. Cech

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthMonash UniversityUniversity of ConnecticutYork UniversityHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyPRC2HistoneMethylationEZH2Histone methyltransferaseGeneticsHistone methylationDNA methylationCell biologyDNAGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polycomb-repressive complex 2 (PRC2) is a histone methyltransferase that is critical for regulating transcriptional repression in mammals. Its catalytic subunit, EZH2, is responsible for the trimethylation of H3K27 and also undergoes automethylation. Using mass spectrometry analysis of recombinant human PRC2, we identified three methylated lysine residues (K510, K514, and K515) on a disordered but highly conserved loop of EZH2. Methylation of these lysines increases PRC2 histone methyltransferase activity, whereas their mutation decreases activity in vitro. De novo histone methylation in an EZH2 knockout cell line is greatly impeded by mutation of the automethylation lysines. EZH2 automethylation occurs intramolecularly (in cis ) by methylation of a pseudosubstrate sequence on a flexible loop. This posttranslational modification and cis regulation of PRC2 are analogous to the activation of many protein kinases by autophosphorylation. We propose that EZH2 automethylation allows PRC2 to modulate its histone methyltransferase activity by sensing histone H3 tails, SAM concentration, and perhaps other effectors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,458

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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