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Enregistrement W2972180383 · doi:10.1101/gad.328849.119

Regulation of histone methylation by automethylation of PRC2

2019· article· en· W2972180383 sur OpenAlexfundno aff
Xueyin Wang, Yicheng Long, Richard D. Paucek, Anne R. Gooding, Thomas Lee, Rachel M. Burdorf, Thomas R. Cech

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthMonash UniversityUniversity of ConnecticutYork UniversityHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyPRC2HistoneMethylationEZH2Histone methyltransferaseGeneticsHistone methylationDNA methylationCell biologyDNAGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) is a histone methyltransferase whose function is critical for regulating transcriptional repression in many eukaryotes including humans. Its catalytic moiety EZH2 is responsible for the tri-methylation of H3K27 and also undergoes automethylation. Using mass spectroscopic analysis of recombinant human PRC2, we identified three methylated lysine residues (K510, K514, K515) on a disordered but highly conserved loop of EZH2. These lysines were mostly mono- and di-methylated. Either mutation of these lysines or their methylation increases PRC2 histone methyltransferase activity. In addition, mutation of these three lysines in HEK293T cells using CRISPR genome-editing increases global H3K27 methylation levels. EZH2 automethylation occurs intramolecularly ( in cis ) by methylation of a pseudosubstrate sequence on the flexible loop. This post-translational modification and cis -regulation of PRC2 are analogous to the activation of many protein kinases by autophosphorylation. We therefore propose that EZH2 automethylation provides a way for PRC2 to modulate its histone methyltransferase activity by sensing histone H3 tails, SAM concentration, and perhaps other effectors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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