Ethanol stress stimulates sumoylation of transcription factor Cst6 which restricts expression of its target genes
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Sumoylation is an essential post-translational modification that functions in multiple cellular processes, including transcriptional regulation. Indeed, transcription factors represent one of the largest groups of proteins that are modified by the SUMO peptide. Multiple roles have been identified for sumoylation of transcription factors, including regulation of their activity, interaction with chromatin, and binding site selection. Here, we examine how Cst6, a bZIP-containing sequence-specific transcription factor in Saccharomyces cerevisiae , is regulated by sumoylation. Cst6 is required for survival during ethanol stress and has roles in the utilization of carbon sources other than glucose. We find that Cst6 is sumoylated to appreciable levels in normally growing yeast at Lys residues 139, 461 and 547, and that its sumoylation level increases in ethanol and oxidative stress conditions, but decreases if ethanol is used as the sole carbon source. To understand the role of Cst6 sumoylation during ethanol stress, we generated a yeast strain that expresses a non-sumoylatable mutant form of Cst6. Cellular levels of the mutant protein are moderately reduced compared to the wild-type form, implying that sumoylation promotes Cst6 stability. Although the mutant can bind DNA, chromatin immunoprecipitation (ChIP) analysis shows that its occupancy level is significantly reduced on promoters of some ethanol stress-regulated genes, suggesting that Cst6 recruitment is attenuated or delayed if it can not be sumoylated. Furthermore, impaired Cst6 sumoylation in the mutant strain correlates with elevated expression of some target genes, either constitutively or during induction by ethanol stress. This is most striking for RPS3 , which shows dramatically increased expression in the mutant strain. Together, our results suggest that sumoylation controls multiple properties of Cst6 to limit the expression of its target genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».