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Enregistrement W2972317394 · doi:10.1002/jimd.12173

The first European guidelines on phenylketonuria: Usefulness and implications for BH<sub>4</sub> responsiveness testing

2019· article· en· W2972317394 sur OpenAlexfundno aff
Roeland A. F. Evers, Annemiek M. J. van Wegberg, Karen Anjema, Charlotte M. A. Lubout, Esther van Dam, Danique van Vliet, Nenad Blau, Francjan J. van Spronsen

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNutricia Research FoundationStichting MetakidsRare Disease FoundationNational PKU AllianceVitafloSwedish Orphan BiovitrumModernaBioMarin PharmaceuticalAlexion Pharmaceuticals
Mots-clésHuman geneticsMedicinePhenylketonuriasGenetic testingPediatricsMEDLINEGeneticsBiologyInternal medicinePhenylalanineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective This study aimed to investigate and improve the usefulness of the 48‐hour BH4 loading test and to assess genotype for BH4 responsiveness prediction, using the new definition of BH4 responsiveness from the European guidelines, as well as an amended definition. Method Applying the definition of the European guidelines (≥100% increase in natural protein tolerance) and an amended definition (≥100% increase in natural protein tolerance or tolerating a safe natural protein intake) to a previous dataset, we first assessed the positive predictive value (PPV) of the 48‐hour BH4 loading test using a cutoff value of 30%. Then, we tried to improve this PPV by using different cutoff values and separate time points. Last, using the BIOPKU database, we compared predicted BH4 responsiveness (according to genotype) and genotypic phenotype values (GPVs) in BH4‐responsive and BH4‐unresponsive patients. Results The PPV of the 48‐hour loading test was 50.0% using the definition of the European guidelines, and 69.4% when applying the amended definition of BH4 responsiveness. Higher cutoff values led to a higher PPV, but resulted in an increase in false‐negative tests. Parameters for genotype overlapped between BH4‐responsive and BH4‐unresponsive patients, although BH4 responsiveness was not observed in patients with a GPV below 2.4. Conclusion The 48‐hour BH4 loading test is not as useful as previously considered and cannot be improved easily, whereas genotype seems mainly helpful in excluding BH4 responsiveness. Overall, the definition of BH4 responsiveness and BH4 responsiveness testing require further attention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,040
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,040
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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