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Enregistrement W2973396524 · doi:10.1021/acs.jpcb.9b06111

Molecular Dynamics Study of the Effect of <scp>l</scp>-Alanine Chiral Dopants on Diluted Chromonic Solutions

2019· article· en· W2973396524 sur OpenAlexafffund
Oscar M. Matus Rivas, Alejandro D. Rey

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular spectroscopy and chirality
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaMcGill University
Mots-clésCounterionChemistryCarboxylateSodiumAlanineMolecular dynamicsMoleculeDopantCrystallographyChemical physicsStereochemistryIonMaterials scienceOrganic chemistryComputational chemistryDopingAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Atomistic molecular dynamics simulations have been performed for disodium cromoglycate (DSCG) chromonic solutions mixed with l-alanine chiral dopants. We study the fundamental molecular mechanisms induced by low concentrations of l-alanine on diluted DSCG solutions, including their effect on the chromonic aggregates, the solvent, and sodium counterions. Simulations reveal that l-alanine molecules primarily interact with DSCG stacks establishing salt bridges between their respective ammonium and carboxylate groups. Our results demonstrate that l-alanine and sodium counterions jointly establish an intricate network of noncovalent interactions around DSCG aggregates that decreases the global electrostatic repulsion of the chromonic system. Two possible structural effects in DSCG aggregates arise from this electronic stabilization: the increment of the total number of consecutively stacked aromatic planes per DSCG aggregate (intracolumnar effect) or the partial separation reduction between neighboring DSCG columnar sections due to the simultaneous bridging of intercolumnar DSCG carboxylate sites by sodium counterions, forming sodium bridges (intercolumnar effect). Sodium bridges may be responsible for the formation of stacking faults in DSCG aggregates in the form of lateral overlap junctions. This mechanism would explain the difference between lower X-ray correlation lengths with the expected persistence length in chromonics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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