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Enregistrement W2973715300 · doi:10.1177/1203475419878161

<i>AAGAB</i> Mutations in 18 Canadian Families With Punctate Palmoplantar Keratoderma and a Possible Link to Cancer

2019· article· en· W2973715300 sur OpenAlexafffundabout
Youssef Elhaji, Cherise Elizabeth Hedlin, Anu S. Nath, Emma L. Price, Christopher Gallant, Stacey A. Northgrave, Peter Hull

Notice bibliographique

RevueJournal of Cutaneous Medicine and Surgery · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSkin and Cellular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Dermatology Foundation
Mots-clésGeneticsKeratodermaGenodermatosisExonMedicineFamily historyMutationPalmoplantar keratodermaMalignancyCancerHyperkeratosisBiologyGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Punctate palmoplantar keratoderma type 1 (PPPK1) presents in late childhood to adulthood with multiple small discrete hyperkeratotic papules on palms and soles. PPPK1 is an autosomal dominant skin disease caused by AAGAB mutations. It has been suggested that PPPK1 may be associated with an increased predisposition to systemic malignancies. Objectives: To evaluate the presence of AAGAB mutations in Canadian families with PPPK1 and the possible increased predisposition to systemic malignancies. Methods: Eighteen unrelated Canadian families with PPPK1 were recruited for this study. Genomic DNA was extracted from saliva and PCR amplification was performed for all AAGAB exons and exon/intron junctions. PCR products were sequenced and analyzed for mutations. A family history of malignancy was obtained from the index case and, when possible, from other family members. Results: We have identified 5 heterozygous AAGAB loss of function mutations in 11 families. The mutation c.370 C&gt;T, p.Arg124* was the most prevalent and was identified in 6 families. A splice site mutation, c.451+3delAAGT, was identified in 2 families. The other mutations c.473delG, p.Gly158Glufs*0; c.550-551insAAT, p.Gly183*; and c.505-506 dupAA, p.Asn169Lysfs*6 were each identified in 1 family. Different cancers were reported in 11 families (Table 1 and Supplemental Figure S1). Conclusions: AAGAB mutations were found in 11 of 18 families with PPPK1. In some families there appears to be an association with cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,641
Score d'incertitude au seuil0,887

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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