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Enregistrement W2973795994 · doi:10.1111/eva.12871

Evaluating genomic data for management of local adaptation in a changing climate: A lodgepole pine case study

2019· article· en· W2973795994 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Applications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesAlberta Innovates Bio SolutionsForest Genetics Council of British ColumbiaGenome Canada
Mots-clésBiologyLocal adaptationPinus contortaAdaptation (eye)Phenotypic traitEvolutionary biologyPhenotypic plasticityEcologyPhenotypeEcological geneticsGeneticsGeneDemographyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

) populations from across western Canada, we compare genomic data to phenotypic and climatic data to assess their effectiveness in characterizing the climatic drivers and spatial scale of local adaptation in this species. We find that phenotype-associated loci are equivalent or slightly superior to climate data for describing local adaptation in seedling traits, but that climate data are superior to genomic data that have not been selected for phenotypic associations. We also find agreement between the climate variables associated with genomic variation and with 20-year heights from a long-term provenance trial, suggesting that genomic data may be a viable option for identifying climatic drivers of local adaptation where phenotypic data are unavailable. Genetic clines associated with the experimental traits occur at broad spatial scales, suggesting that standing variation of adaptive alleles for this and similar species does not require management at scales finer than those indicated by phenotypic data. This study demonstrates that genomic data are most useful when paired with phenotypic data, but can also fill some of the traditional roles of phenotypic data in management of species for which phenotypic trials are not feasible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,160
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle