Bacterial Virus Lambda Gpd-Fusions to Cathelicidins, α- and β-Defensins, and Disease-Specific Epitopes Evaluated for Antimicrobial Toxicity and Ability to Support Phage Display
Notice bibliographique
Résumé
We showed that antimicrobial polypeptides, when translated as gene fusions to the bacteriophage lambda capsid decoration protein gpD, formed highly toxic molecules within E. coli, suggesting that they can retain their antimicrobial activity conformation when fused to gpD. These include gpD-fusions to human and porcine cathelicidins LL37 and PR39, β-defensins HBD3 and DEFB126-Δ (deleted for its many COOH-terminal glycosylation sites), and α-defensin HD5. Antimicrobial toxicity was only observed when the peptides were displayed from the COOH-terminal, and not the NH2-terminal end, of gpD. This suggests that COOH-terminal displayed polypeptides of gpD-fusions can more readily form an active-state conformation than when they are displayed from the NH2-terminal end of gpD. The high toxicity of the COOH-displayed gpD-defensins suggests either that the fused defensin peptides can be oxidized, forming three correct intramolecular disulfide bonds within the cytosol of bacterial cells, or that the versions without disulfide bonds are highly toxigenic. We showed the high efficiency of displaying single epitope 17 amino-acid fusions to gpD on LDP (lambda display particles), even when the gpD-fusion protein was toxic. The efficient formation of high display density LDP, displaying a single disease specific epitope (DSE), suggests the utility of LDP-DSE constructs for use as single epitope vaccines (SEV).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».