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Enregistrement W2973923464 · doi:10.1080/07060661.2019.1669076

Characterization and mapping of stem rust resistance in McNair 701 winter wheat

2019· article· en· W2973923464 sur OpenAlexafffundvenue
Jyoti Saini Sharma, T. Fetch, Colin W. Hiebert

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesWestern Grains Research FoundationManitoba Agriculture, Food and Rural DevelopmentGenome Canada
Mots-clésStem rustResistance (ecology)Rust (programming language)Winter wheatBiologyAgronomyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wheat stem rust, caused by the fungal pathogen Puccinia graminis f. sp. tritici (Pgt), has re-emerged as an important disease of wheat. This pathogen continues to spread and evolve new virulent races. The international letter-code system of nomenclature has been used to pathotype these new emerging races, and gene SrMcN from ‘McNair 701' winter wheat, which is one of the differential lines, was examined in this study. The chromosome and map position of gene SrMcN have not been determined, and thus the objective of this research was to genetically map SrMcN. A doubled haploid population (n = 186) was made from the cross 'LMPG'/'McNair 701' and inoculated with Pgt race QCCJB. The DH population segregated 95 resistant : 91 susceptible lines, which fitted the expected 1 : 1 ratio (χ2 = 0.09, P = 0.77, NS) for a single gene. SrMcN mapped to chromosome 2DL using the 90K iSelect wheat SNP array, and Kompetitive allele specific (KASP) polymerase chain reaction markers located SrMcN to the same position as Sr54 previously found in ‘Norin 40'. Comparison of stem rust seedling reactions using 12 diverse Pgt races indicated that SrMcN and Sr54 had an identical pattern of responses and similar low infection types (from ; to 2−) to races LBBLB, LCBNB and QCCJB. Based on the same chromosomal location on 2DL and identical seedling responses as Sr54 to several races of Pgt with diverse virulence, we assert that the resistance gene in ‘McNair 701' winter wheat previously designated as SrMcN is most likely Sr54.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,174
Écart entre enseignants0,160 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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