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Enregistrement W2975216494 · doi:10.1093/carcin/bgz161

Targeting lysosome function causes selective cytotoxicity in VHL-inactivated renal cell carcinomas

2019· article· en· W2975216494 sur OpenAlexafffund
Nadia Bouhamdani, Dominique Comeau, Alexandre Coholan, Kévin Cormier, Sandra Turcotte

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensAtlantic Cancer Research InstituteUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNew Brunswick Innovation Foundation
Mots-clésLysosomeBiologyCytotoxic T cellCancer researchAutophagyCytotoxicityCell biologyIn vitroGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The inactivation of the tumor suppressor gene, von Hippel-Lindau (VHL), has been identified as the earliest event in renal cell carcinoma (RCC) development. The loss of heterogeneity by chromosome 3p deletion followed by inactivating mutations on the second VHL copy are events present in close to 90% of patients. Our study illustrates a lysosomal vulnerability in VHL-inactivated RCC in vitro. By investigating the mechanism of action of the previously identified STF-62247, a small bioactive compound known for its selective cytotoxic properties towards VHL-defective models, we present the promising approach of targeting truncal-driven VHL inactivation through lysosome disruption. Furthermore, by analyzing the open platform for exploring cancer genomic data (cbioportal), we uncover the high alteration frequency of essential lysosomal and autophagic genes in sequenced biopsies from clear cell RCC patient primary tumors. By investigating lysosome physiology, we also identify VHL-inactivated cells' inability to maintain their lysosomes at the perinuclear localization in response to STF-62247-induced stress and accumulate cytoplasmic inclusion bodies in response to an inefficient lysosomal degradative capacity. Finally, by testing other known lysosomal-disrupting agents (LDAs), we show that these are selectively cytotoxic to cells lacking VHL functions. Our study builds a strong platform that could specifically link genetic clonal ccRCC evolution to lysosomal and trafficking vulnerabilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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