<i>Listeria</i> phages induce Cas9 degradation to protect lysogenic genomes
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY Bacterial CRISPR-Cas systems employ RNA-guided nucleases to destroy foreign DNA. Bacteriophages, in turn, have evolved diverse “anti-CRISPR” proteins (Acrs) to counteract acquired immunity. In Listeria monocytogenes , prophages encode 2-3 distinct anti-Cas9 proteins, with acrIIA1 always present; however, its mechanism is unknown. Here, we report that AcrIIA1 binds with high affinity to Cas9 via the catalytic HNH domain and, in Listeria , triggers Cas9 degradation. AcrIIA1 displays broad-spectrum inhibition of Type II-A and II-C Cas9s, including an additional highly-diverged Listeria Cas9. During lytic infection, AcrIIA1 is insufficient for rapid Cas9 inactivation, thus phages require an additional “partner” Acr that rapidly blocks Cas9-DNA-binding. The AcrIIA1 N-terminal domain (AcrIIA1 NTD ) is dispensable for anti-CRISPR activity; instead it is required for optimal phage replication through direct transcriptional repression of the anti-CRISPR locus. AcrIIA1 NTD is widespread amongst Firmicutes , can repress anti-CRISPR deployment by other phages, and has been co-opted by hosts potentially as an “anti-anti-CRISPR.” In summary, Listeria phages utilize narrow-spectrum inhibitors of DNA binding to rapidly inactivate Cas9 in lytic growth and the broad-spectrum AcrIIA1 to stimulate Cas9 degradation for protection of the Listeria genome in lysogeny.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».