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Enregistrement W2975995592 · doi:10.1038/s41467-019-12187-5

Alterations in ALK/ROS1/NTRK/MET drive a group of infantile hemispheric gliomas

2019· article· en· W2975995592 sur OpenAlexafffund
Ana Guerreiro Stücklin, Scott Ryall, Kohei Fukuoka, Michal Zápotocký, Álvaro Lassaletta, Christopher Li, Taylor Bridge, Byungjin Kim, Anthony Arnoldo, Paul E. Kowalski, Yunan Zhong, Monique Johnson, Claire Li, Arun Ramani, Robert Siddaway, Liana Nobre, Pasqualino De Antonellis, Christopher Dunham, Sylvia Cheng, Daniel R. Boué, Jonathan L. Finlay, Scott Coven, Inmaculada de Prada, Marta Pérez‐Somarriba, Cláudia C. Faria, Michael A. Grotzer, Elisabeth J. Rushing, David Sumerauer, Josef Zámečnı́k, Lenka Krsková, Miguel García-Ariza, Ofelia Cruz, Andrés Morales La Madrid, Keita Terashima, Yoshiko Nakano, Koichi Ichimura, Motoo Nagane, Hiroaki Sakamoto, Maria João Gil‐da‐Costa, Roberto Silva, Donna L. Johnston, Jean Michaud, Bev Wilson, Frank K.H. van Landeghem, Angélica Oviedo, P. Daniel McNeely, Bruce Crooks, Iris Fried, Nataliya Zhukova, Jordan R. Hansford, Amulya NageswaraRao, Livia Garzia, Mary Shago, Michael Brudno, Meredith S. Irwin, Ute Bartels, Vijay Ramaswamy, Éric Bouffet, Michael D. Taylor, Uri Tabori, Cynthia Hawkins

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreUniversity of AlbertaUniversity of OttawaMcGill UniversityChildren's Hospital of Eastern OntarioHospital for Sick ChildrenUniversity of British ColumbiaDalhousie UniversityBC Children's HospitalUniversity of TorontoSickKids Foundation
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenGovernment of CanadaCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario GenomicsNationwide Children's HospitalPediatric Low Grade Astrocytoma Foundation
Mots-clésReceptor tyrosine kinaseGliomaCohortROS1MedicineOncologyInternal medicineBiologyCancer researchReceptorCancerAdenocarcinoma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infant gliomas have paradoxical clinical behavior compared to those in children and adults: low-grade tumors have a higher mortality rate, while high-grade tumors have a better outcome. However, we have little understanding of their biology and therefore cannot explain this behavior nor what constitutes optimal clinical management. Here we report a comprehensive genetic analysis of an international cohort of clinically annotated infant gliomas, revealing 3 clinical subgroups. Group 1 tumors arise in the cerebral hemispheres and harbor alterations in the receptor tyrosine kinases ALK, ROS1, NTRK and MET. These are typically single-events and confer an intermediate outcome. Groups 2 and 3 gliomas harbor RAS/MAPK pathway mutations and arise in the hemispheres and midline, respectively. Group 2 tumors have excellent long-term survival, while group 3 tumors progress rapidly and do not respond well to chemoradiation. We conclude that infant gliomas comprise 3 subgroups, justifying the need for specialized therapeutic strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,443

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations373
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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