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Enregistrement W2976467761 · doi:10.14288/1.0378331

Modeling human gene variants that affect WNT signalling in the chicken embryo

2019· article· en· W2976467761 sur OpenAlexaff
Sarah J. Gignac

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAffect (linguistics)EmbryoGeneBiologyWnt signaling pathwayCell biologyGeneticsSignallingCommunicationPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of rare genetic diseases provides valuable insights into human gene function. The chicken embryo was used as a model to investigate the role of WNT signaling in skeletogenesis and to elucidate the functional consequences of mutations in dominant Robinow Syndrome (RS). RS mutations affect non-canonical WNT signaling that controls a variety of developmental events to regulate convergent extension, cell polarity, and cytoskeletal rearrangement. RS is characterized by short stature, mesomelic limb shortening, hypertelorism, and mandibular hypoplasia. Mutations in dominant RS occur in several components of the non-canonical WNT signaling pathway, and this study is focusing on two mutations in WNT5A ligand (WNT family member) and three mutations in Dishevelled1 (DVL1), a protein that relays WNT signals intracellularly. We delivered the human genes to the chicken embryo using replication competent retroviruses (RCAS) and analyzed morphologic, cellular, and molecular effects in the forelimbs and mandible. Misexpression of mutants in dominant RS led to a shortening of the forelimb and mandible and caused polarity disruptions in the chondrocytes that were not seen in the GFP virus controls. The variants were unable to activate canonical WNT signaling and over-activated non-canonical WNT signaling, demonstrating the importance of non-canonical WNT signaling in skeletogenesis. Dominant RS mutations have dominant neomorphic effects on chondrogenesis that interfere with the function of the wild-type protein. This work establishes that the dominant effect of the mutations leads to elevated non-canonical WNT signaling and randomizes the distribution of planar cell polarity molecules of which produces shortened skeletal elements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,980
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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