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Enregistrement W2976906159 · doi:10.1016/j.bpsgos.2021.07.008

Identifying the Common Genetic Basis of Antidepressant Response

2021· article· en· W2976906159 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiological Psychiatry Global Open Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteWomen and Children’s Health Research InstituteDalhousie UniversityUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesJanssen Research and DevelopmentNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Mental HealthHôpitaux Universitaires de GenèveLundbeck CanadaSveučilište u ZagrebuOtsuka Canada PharmaceuticalBerlin Institute of HealthIstituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri - IRCCSItalfarmacoWashington University School of Medicine in St. LouisTaipei Veterans General HospitalH. Lundbeck A/SMedicinski Fakultet, Sveučilište u ZagrebuFreie Universität BerlinOtsuka PharmaceuticalHLS TherapeuticsRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnJanssen CanadaDalhousie UniversityHumboldt-Universität zu BerlinMenzies Centre for Australian Studies, King's College London, University of LondonNational Yang-Ming UniversityWestfälische Wilhelms-Universität MünsterNational Health Research InstitutesKansai Medical UniversityUniversity of AlbertaImperial College LondonUniversity of TorontoGlaxoSmithKlineAarhus UniversitetshospitalLundbeckfondenAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgServierMedical Research CouncilAstraZenecaUniversità di BolognaMassachusetts General HospitalSackler TrustEli Lilly and CompanySanofiBroad InstituteUniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w PoznaniuInnovative Research Group Project of the National Natural Science Foundation of ChinaAarhus UniversitetQIMR Berghofer Medical Research InstituteWellcome TrustCampbell Family Mental Health Research InstituteMcGill UniversityUniversity of PittsburghPfizerBristol-Myers Squibb
Mots-clésAntidepressantBasis (linear algebra)Computer sciencePsychologyNeuroscienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antidepressants are a first-line treatment for depression. However, only a third of individuals experience remission after the first treatment. Common genetic variation, in part, likely regulates antidepressant response, yet the success of previous genome-wide association studies has been limited by sample size. This study performs the largest genetic analysis of prospectively assessed antidepressant response in major depressive disorder to gain insight into the underlying biology and enable out-of-sample prediction. Genome-wide analysis of remission (nremit = 1852, nnonremit = 3299) and percentage improvement (n = 5218) was performed. Single nucleotide polymorphism–based heritability was estimated using genome-wide complex trait analysis. Genetic covariance with eight mental health phenotypes was estimated using polygenic scores/AVENGEME. Out-of-sample prediction of antidepressant response polygenic scores was assessed. Gene-level association analysis was performed using MAGMA and transcriptome-wide association study. Tissue, pathway, and drug binding enrichment were estimated using MAGMA. Neither genome-wide association study identified genome-wide significant associations. Single nucleotide polymorphism–based heritability was significantly different from zero for remission (h2 = 0.132, SE = 0.056) but not for percentage improvement (h2 = −0.018, SE = 0.032). Better antidepressant response was negatively associated with genetic risk for schizophrenia and positively associated with genetic propensity for educational attainment. Leave-one-out validation of antidepressant response polygenic scores demonstrated significant evidence of out-of-sample prediction, though results varied in external cohorts. Gene-based analyses identified ETV4 and DHX8 as significantly associated with antidepressant response. This study demonstrates that antidepressant response is influenced by common genetic variation, has a genetic overlap schizophrenia and educational attainment, and provides a useful resource for future research. Larger sample sizes are required to attain the potential of genetics for understanding and predicting antidepressant response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,326

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle