Trimethylamine-N-oxide: A Novel Biomarker for the Identification of Inflammatory Bowel Disease
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: The gastrointestinal (GI) microbiome is recognized for potential clinical relevance in inflammatory bowel disease (IBD). Data suggest there is a disease-dependent loss of microbial diversity in IBD. Trimethylamine-N-oxide (TMAO) is generated by GI anaerobes through the digestion of dietary phosphatidylcholine and carnitine in a microbial-mammalian co-metabolic pathway. Elevated levels have been linked to heart disease, yet little is known regarding TMAO in IBD. Aim: To determine if TMAO plasma levels in IBD are altered compared to controls and if they correlate with disease presence or activity. Methods: Liquid chromatography-tandem mass spectrometry was used to measure TMAO, choline and carnitine plasma levels in 479 subjects (373 non-IBD controls, 106 IBD). Subjects were also genotyped for the flavin monooxygenase (FMO) 3 variants E158K and E308G. Results: Plasma TMAO levels were 2.27μM lower in the IBD population compared to the control population (p= 0.0001). Lower TMAO levels were similarly seen in active ulcerative colitis (UC) (1.56μM) versus inactive disease (3.40μM) (p= 0.002). No difference was seen in active Crohn's disease (CD) versus inactive CD. No inter-group variation existed in plasma TMAO levels based on FMO3 genotype. Choline levels were higher in IBD, while carnitine levels were similar between the two groups suggesting lower TMAO levels in IBD were not due to dietary differences. Conclusion: Decreased TMAO levels are seen in IBD compared to a non-IBD population. These data suggest that TMAO may have potential as a biomarker to support IBD diagnosis as well as to assess disease activity in UC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».