Cloing and analyzing of cDNA for ethylene receptor, lcersi, of lychee (Litchi chinensis)
Notice bibliographique
Résumé
The cDNA for an ethylene receptor, LcERS1, of Lychee (Litchi chinensis Sonn.) was obtained by a combination of RT-PCR and RACE technique. The length of cloned cDNA was 2, 193 bp, which include an Open Reading Frame of 1, 848 bp,from No.87 to No. 1934, encoding 615 amino acids, and about 68kD molecular weights. Genbank accession number for LcERS1 is AY311484. The putative protein has three conserved regions, one of them has the homologue with the histidine kinase A (phosphoreceptor) region, dimerisation and phsphoacceptor domain of histidine kinases. These regions are typical phosphotransfer site in the signal transduction system. The other region is GAF domain, which has more positives with the ethylene receptor gene (ers). The analysis of the protein structure and function suggested this putative protein be similar to the ethylene receptor gene, histidine protein kinase and the kinase region of the bacterium two-component signaling. The H and F motifs of the ethylene receptor genes were observed in the kinase region of the putative protein of lychee, they lies in 423-432 amino acid residues and 532-543 the amtno acid residues respectively. The conserved, sequence of His MNHE.MRTPM. and F is LMQTILNTMGA.. The putatve protein we obtained from lychee has the typical characters of ethylene receptor gene, which including three transmembrane regions in the N-terminal, one conserved histidine kinase domain and one GAF domain in the C-terminal. We strongly suggested that the cDNA sequence from lychee be the full length cDNA gene of the ethylene receptor gene (ers).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».