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Enregistrement W2978232132

Cloing and analyzing of cDNA for ethylene receptor, lcersi, of lychee (Litchi chinensis)

2003· article· en· W2978232132 sur OpenAlexvenueno aff
Han Jicheng, Xuanjun Fang

Notice bibliographique

Revue分子植物育种 · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePlant-Derived Bioactive Compounds
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComplementary DNABiologyGeneHistidine kinaseGenBankTransmembrane domainTransmembrane proteinPeptide sequenceOpen reading frameMolecular biologyHistidineGeneticsBiochemistryAmino acidReceptor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cDNA for an ethylene receptor, LcERS1, of Lychee (Litchi chinensis Sonn.) was obtained by a combination of RT-PCR and RACE technique. The length of cloned cDNA was 2, 193 bp, which include an Open Reading Frame of 1, 848 bp,from No.87 to No. 1934, encoding 615 amino acids, and about 68kD molecular weights. Genbank accession number for LcERS1 is AY311484. The putative protein has three conserved regions, one of them has the homologue with the histidine kinase A (phosphoreceptor) region, dimerisation and phsphoacceptor domain of histidine kinases. These regions are typical phosphotransfer site in the signal transduction system. The other region is GAF domain, which has more positives with the ethylene receptor gene (ers). The analysis of the protein structure and function suggested this putative protein be similar to the ethylene receptor gene, histidine protein kinase and the kinase region of the bacterium two-component signaling. The H and F motifs of the ethylene receptor genes were observed in the kinase region of the putative protein of lychee, they lies in 423-432 amino acid residues and 532-543 the amtno acid residues respectively. The conserved, sequence of His MNHE.MRTPM. and F is LMQTILNTMGA.. The putatve protein we obtained from lychee has the typical characters of ethylene receptor gene, which including three transmembrane regions in the N-terminal, one conserved histidine kinase domain and one GAF domain in the C-terminal. We strongly suggested that the cDNA sequence from lychee be the full length cDNA gene of the ethylene receptor gene (ers).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,601

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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