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Enregistrement W2978243962 · doi:10.1038/s41467-019-12448-3

Efficient inter-species conjugative transfer of a CRISPR nuclease for targeted bacterial killing

2019· article· en· W2978243962 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchOntario Genomics
Mots-clésCRISPRPlasmidBacterial conjugationSalmonella entericaBiologyNucleaseEscherichia coliBacteriaCas9Computational biologyGeneticsGeneMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The selective regulation of bacteria in complex microbial populations is key to controlling pathogenic bacteria. CRISPR nucleases can be programmed to kill bacteria, but require an efficient and broad-host range delivery system to be effective. Here, using an Escherichia coli and Salmonella enterica co-culture system, we show that plasmids based on the IncP RK2 conjugative system can be used as delivery vectors for a TevSpCas9 dual nuclease. Notably, a cis-acting plasmid that encodes the conjugation and CRISPR machinery conjugates from E. coli to S. enterica with high frequency compared to a trans system that separates conjugation and CRISPR machinery. In culture conditions that enhance cell-to-cell contact, conjugation rates approach 100% with the cis-acting plasmid. Targeting of single or multiplexed sgRNAs to non-essential genes results in high S. enterica killing efficiencies. Our data highlight the potential of cis-acting conjugative plasmids as a delivery system for CRISPR nucleases or other microbial-altering agents for targeted bacterial killing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,199
Score d'incertitude au seuil0,355

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle