Genetic Polymorphisms Predict Response to Anti-TNF Treatment in Crohnʼs Disease
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Anti-tumor necrosis factor-α therapy (anti-TNF Tx) is an important treatment for Crohn's disease (CD). However, a significant proportion of CD patients treated with anti-TNF Tx do not improve clinically. Predicting treatment response or failure is important both clinically and economically. Methods: CD patients were recruited from a university digestive disease practice. We included consecutive CD patients who received anti-TNF Tx, who had available medical records on treatment duration and efficacy, and for whom genomic DNA was available. Patients with allergic reactions were excluded. CD patients were grouped as “ever-responders” if they had a response to treatment or as “non-responders.” Seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) linked with either CD and/or anti-TNF Tx were assessed in patient DNA samples: ATG16L1 (rs10210302, T300A rs2241880), Fas Ligand (-843 rs763110), IBD5 (rs2522057), FCGR 3A (rs396991), TNF (-308 rs1800629, -238 rs361525). Results: A total of 121 patients were included: 21 were non-responders to anti-TNF Tx and 100 were ever-responders. Fas ligand SNP genotype frequencies, TNF gene -308 SNP genotype frequencies, and the combination of these were significantly different between non-responders and ever-responders based on multivariable analysis controlling for Montreal disease behavior and perianal disease. The odds of a patient with a Fas ligand CC genotype being a non-responder were four-fold higher as compared to a TC or TT genotype (p=0.009, OR 4.30 CI 1.45-12.80). The presence of the A (minor) TNF gene -308 allele correlated with a three-fold higher odds of being a non-responder (p=0.049, OR 2.88 CI 1.01-8.22). Patients with the combination of the Fas ligand CC genotype and the TNF -308 A allele had nearly fivefold higher odds of being a non-responder (p=0.015, OR 4.76 CI 1.35-16.77). No difference was observed for the remaining SNPs. The Fas ligand CC genotype was present in 37% of patients, while the TNF -308 A allele was present in 29% of patients. Conclusion: In CD patients, both the Fas ligand rs763110 and the TNF -308 rs1800629 SNPs are highly associated with response to anti-TNF Tx. SNP genotyping utilizing DNA obtained from peripheral blood, used together with assessment of clinical disease behavior, may help select patients most likely to benefit from anti-TNF Tx and permit efficient and cost-effective treatment by avoiding expensive and morbid therapy that is likely to fail.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».