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Enregistrement W2978643256 · doi:10.14309/00000434-201610001-02534

Emerging Presence of Zoonotic Gastrointestinal Pathogen: Identification of Neorickettsia Spp. in Fish Species in Grenada, West Indies

2016· article· en· W2978643256 sur OpenAlexaff
LeighMae Provencher, Kathryn Gibson

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyZoologyDigeneaEcologyHelminthsTrematoda

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The presence of Neorickettsia, a genus of obligate intracellular bacteria is possible in Grenada, West Indies, suggested through its prevalence in its neighboring continents of USA and South America and their shared waterways. The geographical presence of different Neorickettsia species has both medical and veterinary implications, causing Sennetsu Fever in humans (N. sennetsu), salmon poisoning disease in dogs (N. helminthoeca), and Potomac horse fever in equids (N. risticii). There is also concern regarding the not yet elucidated human pathogenicity of Neorickettsia spp.in relation to known trematode-associated gastrointestinal illnesses in humans. Our study serves to begin the process of defining the presence or suggesting the absence of Neorickettsia in fish from Grenada, West Indies. Methods: Forty-two specimens consisting of four different locally consumed freshwater fish species (Hypostomus Plecostomus - Common Pleco,Oreochromis mossambicus -Round Scad/Robin, Decapterus punctatus-Mozambique Tilapia, and Selar crumenopthalmus- Bigeye Scad/Jack) were acquired deceased, and refrigerated minimally awaiting dissection. Tissue samples (1cm depth, 4x4cm area) were taken from the left lateral musculature of each fishand examined microscopically for encysted trematodes. Potential cysts were subjected to RFLP analysis to identify potential Neorickettsia spp host trematode spp.Table 1: Summary of Freshwater Fish DissectionsResults: One Selar crumenopthalmus specimen yielded a Neorickettsia-incompatible nematode species Anasakis typica, identified through RFLP analysis. The remaining 41 samples also failed to yield positive identification of trematode species with Neorickettsia-hosting capabilities. Conclusion: Our study addressed the geographic distribution of Neorickettsia spp. in the country of Grenada, specifically its freshwater rivers. Through dissection of freshwater fish followed by DNA analysis of any potential trematodes, we documented negative results in an initial survey for trematodes which could potentially serve as hosts for Neorickettsia spp. in an assortment of species of locally consumed freshwater fish. Further studies expanding the survey to a greater variety and number of fish spp. as well as other implicated species such as freshwater snails, piscivorous and insectivorous bats, and mongooses will provide further insight regarding the geographic distribution of Neorickettsia in Grenada, WI, and will assist to inform associated risks posed to the regional population's gastrointestinal health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,068

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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